DNA有很多DNA编码信息区每一段DNA编码信息区就是对应一种产物，还是每种产物对应的DNA片段都在DNA编码信息区

来源：蜘蛛抓取(WebSpider) 时间：2020-03-31 08:08 标签： DNA编码信息

为 查 询 序 列, 利 用 T BLASTN 和 BLASTN 软件搜索数据庫中 与大鼠 WDR45L 基因同源的 cDNA 和 EST 序列把检出序列组装为连续体 Contig, 在 UCSC 程序上进行 EST 连续体序列的拼 接和基因组序列与 EST 序列的双重校对。 克隆基因采用 RTPCR 測序证实, 并进行核 酸与蛋白质特性的生物信息学分析结果 综合利用基因组和 EST 因在胃癌、 结肠癌、 乳腺癌、 卵巢癌、 肾癌和 胰腺癌等恶性腫瘤中表达上调。结论 综合 利用基因组和 EST 序列信息是更为科学的 计算机克隆方法, 进一步深入研究 WDR45L 基因的功能具有重要生物学意义 中华肿瘤防治杂志, [ ABSTRACT] OBJECTIVE To clone and identify the rat 主治医师, 主要从事肿瘤基础及微创治疗工作。 Tel 86- 22- E mail peterrock. com ?1050? 王海涛, 等 WDR45L 大鼠同源基因DNA编码信息区 cDNA 的克隆及生物信息学分析 鉴定肿瘤相关基洇对肿瘤分子机制研究以及寻找 分子诊断和治疗靶点至关重要模式生物和人类具有 非常相似的基因组结构、 生理机能和生化代谢特征, 通 過计算机克隆已知基因在模式生物中的同源基因不仅 极大地促进了人类基因功能研究而且是新基因发现的 有效手段[ 1- 2]。人 WDR45L 基因是于 2004 年新克隆 嘚 WD40 重复蛋白新成员, 研究发现该基因在多种肿 瘤中异常表达, 可能是通过其依赖性细胞自噬缺陷而 促使肿瘤进展[ 4], 但其正常的生理功能以及在多種肿 瘤进 0 展中的确切作用机制还不清楚目前已从斑马 鱼、 非洲爪蟾等生物中克隆到其同源基因, 而大鼠基因 尚未克隆, 如果能获得大鼠的 WDR45L 同源基因, 不 仅可以确证其进化上的保守性, 提示它的功能, 而且为 建立 WDR45L 转基因或基因敲除动物模型, 为深入研 究 WDR45L 的生物功能奠定重要基础。 1 材料与方法 1. 1 材料 TRIzol 试剂购自 GibcolBRL, RTPCR 试剂盒、 pGEMT easy , 检出与查询氨基酸序列有同源性的 EST 序列, 把检出 序列组装为连续体 Contig , 以此连续体序列为查询 序列再进行 BLAT 检索, 获得该基因的详细信息, 在 UCSC 网站上利用 EST 、 cDNA 和基因组序列通过手 工拼接外显子获得新基因, 正确序列应获得 EST 序列 与基因组序列的双重支持, 并符合外显子、 内含子剪切 规则通过手工比对 Genebank、 377 DNA 全自动测序 仪进行, 对插入片段先用通用引物 SP6 和 T7 进行双向 测序, 然后设计接力引物测出插入片段的全部序列。 1. 4 大鼠 WDR45L 基因的核酸与蛋白质特性的生物 信息学分析 1 新基因的结构和染色体定位 采用 UCSC 的 BLAT 程序分析新基因的结构特征 外显子与内

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