本作改编自同名动画《纸盒战机W》讲述了前作多年之后,新主角大空弘和前作主角山野板的全新冒险故事本作的界面和前作相差不大,在《纸盒战机 完全版》中出现嘚双持武器也因为弘使用的机体珀尔修斯而在本作顺理成章的出现。