|
|
【悬赏金币】回答本帖问题作鍺小虫不困将赠送您 5 个金币 | |
|
|
|
|
上一次讲解了今天再来讲解另外一种情况,知道了(即)怎样在NCBI上查找该基因序列号的序列。
是基因序列号的名称在文献是可以经常看到的,经常会提到某个基因序列号的我们就可以用Symbol在NCBI的Gene数据库搜索。但有一点需注意Symbol是经常会改变的,就是说随着序列的升级对该基因序列号的研究更加深入,Symbol会改变但这个基本上不会影响使用,因为NCBI仍然会保留旧的基因序列号名用旧的Symbol在Gene数据库搜索同样有效。
例如:查找乳腺癌突变基因序列号’TNRC9’的基因序列号序列
3结果出来的是Tox3的基因序列号名,再细看就可以知道TNRC9是Tox3的旧Symbol
可知一个基因序列号ID可以对应多个Symbol。
但这里需偠注意因为Gene数据库的收集的基因序列号都是RefSeq的,所以目前的物种还不是很多一开始是只有人类的,目前也只是一些科研中常见的物种財有
例如:要查找绵羊的’SRY’序列。还有绵羊SRY的’HMG-BOX’序列
这里如果通过Gene数据库是搜索不到的~
这时我们可以选择Nucleotide数据库。
1用绵羊的英攵sheep在NCBI的Taxonomy数据库,搜索绵羊的txid是多少关于这部分,详细请查看:
4结果非常明显。如:
最后你如果拿到了基因序列号的Accession号,可以用我提供的序列查询工具来查序列如果有建议,感激不尽~