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Illumina推出两款新测序仪
Illumina在摩根大通健康产业投资会上宣布推出两款新测序仪:NextSeq 500 和 HiSeq X Ten。
这两款新测序仪采用了新的测序技术,分别瞄准两个不同的细分市场。NextSeq 500是桌上型测序仪,有两种测序模式&中通量模式每个run产出40G数据,高通量模式产生120G数据。&简而言之,NextSeq 500是将HiSeq的快速模式移植到了MiSeq大小的机器上&,Illumina CEO Jay Flatley如是说。
HiSeq X Ten主要是为了大规模的基因组重测序项目设计的。这个测序仪10个一套打包出售,每个测序仪能在一天之内产生5个人类基因组的数据,或是3天1.8T的数据量。
Illumina同时还将在今年第二季度推出两款HiSeq的新试剂。今年5月,Illumina将提供&6天1T&的新试剂,同时计划将HiSeq的快速模式升级至2&250 bp。
Flatley同时透露,Illumina今年将为HiSeq 2500申请FAD认证。
NextSeq 500
NextSeq 500系统整合了新的SBS技术和改进后的光学系统。
Illumina现有的测序仪采用四色荧光,分别用四种不同的光学通路识别。NextSeq 500将采用&双通路&,碱基G无色(暗),A和C为一个荧光,T有两个荧光。
双通路模式使得测序试剂更为简单,也让测序过程中的图像减半。
NextSeq 500可以使用两种不同的flow cell。中通量的FC含有130M clusters,用2&75试剂能在15小时内产生16-19G数据,或使用2X150试剂,在26小时内产生32-39G数据。高通量FC含有400M clusters,用1X75试剂能在11小时内产生23-30G数据,2&75试剂能在18小时内产生50-60G数据,或使用2&150试剂,在29小时内产生100-120G数据。第一种试剂很适合开展无创产前诊断,而2&150试剂能在一个run中产生30&的人类基因组数据。
除了使用&双通路&测序试剂,Illumina还重新设计了光学元件。Flatley说NextSeq 500采用新的LED摄像模块,大大节省元件本身的尺寸、重量和成本。采用该技术,一台NextSeq上整合了6个摄像头,使该机器的图像处理能力达到了MiSeq的6倍。
NextSeq 500还采用了其它20余种新技术。该机器使用新型的flow cell设计,可以适应低分辨率的光学元件,以及新的测序试剂,同时它还有其他优点,比如可以在干燥的条件下运输。
NextSeq 500的主要竞争对象是Life Tech的Ion Proton。Ion Proton的PI芯片能产出10G数据,PII芯片将能产生20-30G数据。
NextSeq 500是目前唯一一台能在单个run中产出一个人类基因组数据的桌上型测序仪。该机器的操作将与MiSeq一样简单,适用于多种科研和转化应用,比如无创产前诊断。无创产前诊断市场已经出现了分化,现有的大型服务商已经基于HiSeq研发出了一套标准流程,但新进的竞争者并没有足够的样本来完成流程开发。该机器的市场定位也面向需要做少样本量人类重测序的实验室。
HiSeq X Ten
NextSeq是一款高度灵活的测序平台,但Illumina的另一款新机器只有一个应用&人类基因组重测序。
HiSeq X Ten能在一天时间内产生600G数据,足以得到5个人类的基因组;或是在不到三天的时间里产出1.8T数据。Flatley预测,&工厂级别&的人类基因组重测序需求很快就要爆发。
第一套HiSeq X Ten系统将在今年3月发货,Illumina已经卖出三套,买家分别是韩国的千年基因,澳大利亚的Garvan研究所和美国的Broad研究所,其中Broad买了14台。Flatley预计今年能卖出5套。
HiSeq X Ten采用了新的芯片技术,提高了cluster的密度,大大压缩了测序周期。目前HiSeq采用的flow cell上,cluster是随机产生排布的;而HiSeq X Ten的clusters在nanowells中产生,有固定的精确位置。通过这个技术改进,可以得到更多的数据,同时图像处理也更为简便。这个测序仪配备了双向扫描,能把扫描速度提升6倍,同时还采用了新的软件处理大数据量,快速的双端测序转变,以及新的聚合酶。
HiSeq X Ten使得1000美金的人类基因组测序真正成为了可能。一个run的试剂价格为$12,700,能产生16个人类基因组数据,折合800美金一个人类的基因组。每个基因组再平摊137美金的仪器折旧,60美金左右的建库等其它成本,总成本能控制在1000美金左右。
一年下来,一组HiSeq X Ten能完成18000个人的基因组测序,4组HiSeq X Ten在一年中测得的人类基因组将比之前全世界的总和还多。它的市场定位也主要面向大规模的群体研究,Illumina预计这类研究的需求将会越来越大。Fellis(Illumina的市场和产品总监)说:&通常这种项目都是国家级的,而科研单位都不愿把样本交给其他国家的测序商,比如BGI。&
Copyright@Majorbio 上海美吉生物医药科技有限公司illumina 的 NextSeq 500 大概什么价格_百度知道
illumina 的 NextSeq 500 大概什么价格
我有更好的答案
但是测序长度短,深度深测序reads 是miseq 的20倍左右,有高通量模式和快速模式
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出门在外也不愁夜雨听风话价值: BGISeq-500问世 使用成本比同行低1/3
[导读] 行业人士也有感叹,这以前购买了illumina的NextSeq 500系统的岂不是亏大了。华大继6月份发布的... - 雪球&来自雪球BGISeq-500问世 使用成本比同行低1/3[导读]&行业人士也有感叹,这以前购买了illumina的NextSeq 500系统的岂不是亏大了。华大继6月份发布的“超级测序仪”Revolocity后,华大基因就华丽丽地从一个测序服务商一举站到了与illumina相同的高度,成为了illumina在中国甚至可能会在其他发展中国家最强劲的对手。  日,在第十届国际基因组学大会(ICG-10)上,全球最大的基因组学研发机构华大基因发布了其自主研发的新型桌面化测序系统BGISEQ-500。该仪器是华大基因继今年6月推出“超级测序仪”―Revolocity之后的第二款测序系统。华大基因2013年全资并购Complete Genomics (CG),经过两年的攻坚,于今年连续发布多款测序系统,展现了其并购整合之后,迅速实现技术转化及再创新,建立起了生命科学领域高端仪器研发和制造的雄厚实力。  BGISEQ-500系统采用探针锚定聚合技术(cPAS)以及改进的DNA纳米球技术(DNB),配备双芯片平台,可适配FCL和FCS两种芯片类型,通过不同设置可实现16种测序模式。  此系统一出,行业人士也有感叹,这以前购买了illumina的NextSeq 500系统的岂不是亏大了。华大继6月份发布的“超级测序仪”Revolocity后,华大基因就华丽丽地从一个测序服务商一举站到了与illumina相同的高度,成为了illumina在中国甚至可能会在其他发展中国家最强劲的对手。  下表对比了BGISeq-500和NestSeq 500在通量、读长、质量以及运行时间上的一些特性。  1.目标定位不同  NextSeq 500的主要目标客户就是医院、检验所级别的中小型规模应用场景,有别于Hiseq定位于测序工厂,Miseq定位于实验室高精度快速的科研用途。通量可上可下,可以做人类全基因组测序,也可以做Nifty。  2. 通量与读长不同  从官方数据上看,两家500各领风骚,各有千秋。BGISeq-500 通量(FCL、FCS两种芯片高低通量搭配)达8-200G,范围比Illumina广。对于读长从数据上看Illumina家更有优势。  3.碱基错误率(质量)  Illumina家的测序质量经过市场检验,虽然BGISeq官方给出Q30以上的碱基达到85%,但并未根据读长、PE/SE模式给出具体数据,所以看到真正的raw data之前,对测序质量暂且不进行评论。  4.运行时间  从运行时间来看,两款系统相当。NextSeq 500的运行时间大概为12-30小时,BGISeq-500的运行时间大概为24小时,对于要求快速产出的医学检验有非常大的吸引力。  对于华大基因的这款BGISEQ-500系统,业内人士还是充满了期待。  据华大基因研究院院长、首席科学家徐讯介绍,BGISEQ-500系统基于原有CG技术基础优化而成,个人基因组检测精度达到了99.99%,完全满足临床需求,达到了国际领先水平。该测序仪的样品制备和测序操作都可通过配件自动完成,配备了无线射频识别(RFID)的样本追踪系统,可监控并记录实验全流程,结合其简洁的触控式操作界面,可真正实现一键测序。对于临床使用,可以通过其内置的应用软件直接生成分析报告,从DNA样本到数据分析结果的全过程最快可在24小时内完成。  BGISEQ-500配备双芯片平台,可适配FCL和FCS两种芯片类型,通过不同设置可实现16种测序模式,数据产出通量在8Gb—200Gb之间自由选择,可满足实验室和临床不同应用情景的测序需求,而无需同时购置低中高三种不同通量测序仪。在发布会上,华大基因还同时展示了个人基因组测序、农业基因组测序、转录组测序等应用的实际测试数据,以及在产前诊断、遗传病检测、肿瘤基因检测等临床应用方面的实例,在准确度和一致性方面均达到甚至超过一线成熟商业测序系统的水平。  一、技术惊艳  BGISeq-500核心技术不是“边合成边测序”,而是探针锚定与纳米球“珠联璧合” 。曾经以为BGISeq-500是基于边合成边测序(SBS)技术,然而如今官方竟然公布核心技术不是SBS,而是采用探针锚定聚合技术(cPAS)以及DNA纳米球技术(DNB)。  读到这里,你心中是否有这样的疑惑:SBL怎么能做到100的读长而且运行时间这么短呢?  从华大基因的官方网站上得知,BGISeq-500使用优化的联合探针锚定聚合技术(cPAS)和改进的DNA纳米球(DNB)技术。首先DNA分子锚和荧光探针在纳米球上进行聚合,随后高分辨率成像系统对光信号进行采集,光信号经过数字化处理后即可获得待测序列。其中DNB通过线性扩展增强信号,降低单拷贝的错误率。此外,DNB大小与芯片上的活性位点的大小匹配,每个位点结合一个DNA纳米球,在保证了测序精度的情况下提高了测序芯片的利用效率。  二、价格惊艳  对于客户而言,除了通量、读长、质量和运行时间外,最关心还是价格。华大官方声称BGISeq-500仪器使用成本比同行低三分之一,个人基因组价格为6699,甚至低于X ten的8000左右。虽然还不知道后续维护成本,但运行成本一定会大杀illumina的气势。据悉,该系统将于今年12月25日开始接受预定,并计划于日实现交付。汪建高度赞扬BGISEQ-500  华大基因董事长汪建表示,BGISEQ-500见证了人类基因组计划以来一个新时代的开启,将推动以基因作为支撑的生命科学、生物产业甚至生命经济发展,用低廉的成本、高质量、高通量的测序平台,真正实现人类基因组计划以来科学家们的梦想和希望。  众所周知,中国具有大样本量、大人群、大病源的优势,那么华大基因能否利用BGISeq-500的低成本、高质量,共享数据,推进精准医学事业的发展,让全人类的农业和医学进入一个全新的阶段呢?我们拭目以待!打赏打赏支付成功才能发起提问重新支付成功打赏该贴1元分享到雪球动态欢迎打赏,请选择打赏金额1 元6 元10 元66 元100 元其他金额支付宝支付立即支付支付即代表同意 同时转发到我的首页发布分享到微信扫一扫

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