天天爱消除口鼻周围青春痘长鼻偌偌

来源：蜘蛛抓取(WebSpider) 时间：2016-07-16 13:20 标签： 如何消除鼻子红血丝
游戏“天天爱消除”曾经风靡一时，想必大家一定都玩过。其实在重测序分析中也有一个分析“爱消除”，那就是选择消除分析。群体进化选择消除分析：简单的说就是基因组某区域由于受到了选择而消除多态性。选择消除分析是正向选择在物种基因组上留下的印迹。与野生祖先相比，栽培或驯化的物种发生选择消除的区域遗传多样性显著降低，这是驯化区域的典型特征。图1 物种驯化过程中多态性的变化趋势
选择消除分析可以做什么？挖掘人工驯化过程中受选择的基因，如家猪与肉质相关的基因，大豆中与油含量相关的基因。挖掘物种适应性进化中受选择的基因，如藏猪的高原适应性，毛果杨高低纬度气候适应性。&
选择消除分析常用的方法1、基于群体分化（Fst）群体的固定系数F反映了群体等位基因杂合性水平。固定系数F是F统计量（Fst）的一个特例。Fst分析表示群体的分化程度，值越大，群体分化程度越高，受选择程度越高。&图2 Fst 分布图&Fst分布图，横坐标代表不同的染色体名称，纵坐标代表相应染色体窗口内Fst值，另外的两条虚线代表两种选择阈值（top 5%或1%）。2、基于群体多样性分析π用来分析碱基多态性，多态性越低，受选择程度越高。&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&&图3 碱基多样性分析[1]&&&π结果分析图中，横轴表示基因组的位置，纵坐标表示π值，图中的曲线表示3个群体的多态性水平。群体π值反映了群体基因组碱基多样性。3、基于群体中性进化的分析在标准中性进化模型下，Tajima’s D 的理论值为零。如果Tajima’s D 值为正，表明存在大量的中等频率的等位基因，这可能是由于群体瓶颈效应，群体结构，或者平衡选择引起的。如果 Tajima’s D 值为负，表明存在大量的低频等位基因位点。Tajima’s D分析表示中性进化，越偏离0，受选择程度越高。&&&&&& &&&&&&图4 Tajima’s D分析[2]
选择消除分析多种算法的结合1、Fst和θπ 的结合Fst 和θπ已被证实是一种很有效力地检测选择消除区域的方法，特别是在挖掘与生存环境密切相关的功能区时，往往可以得到较强的选择信号，图5为Fst与θπ选择消除分析结果展示，二者共同筛选较强的选择信号，便于目标基因的筛选。图5 Fst和θπ的选择消除分析[3]如何看懂这张图：横坐标为θπ 的比值（驯化／野生），纵坐标为Fst值，分别对应上面的频率分布图和右侧的频率分布图，中部的点图则代表不同窗口内的相应的Fst和θπ 比值。其中最上方蓝色和绿色区域为θπ选择出来的top 5%区域，红色区域为Fst所选择top 5%区域，中间蓝色和绿色区域为Fst和θπ的交集，即为候选的位点。2、Tajima’s D和θπ的结合&&&&&&&&&&&& 图6 Tajima’s D和θπ的选择消除分析如何看懂这张图：横坐标为θπ 值，纵坐标为Tajima’s D值，分别对应上面的频率分布图和右侧的频率分布图，中部的点图则代表不同窗口内的相应的θπ和Tajima’s D值。其中蓝色区域为θπ选择出来的top 5%区域，绿色区域为Tajima’s D选择出的top 5%&区域，红色箭头所指的区域为θπ和Tajima’s D的交集，即为候选的位点。&3、Fst和Hp的结合&&&&&&&&&&&&&&&图7 Fst和Hp的选择消除分析[4]如何看懂这张图：横坐标表示染色体上的某个区间，纵坐标表示Hp、Fst，图中的蓝点表示杂合率（Hp），图中的橙黄色点表示固定系数（Fst）。通常选择杂合率Hp较小，群体分化系数Fst较大的点，图中两虚线间的点即为候选位点。&
诺禾致源群体进化的优势1、信息分析内容全面丰富，最大程度的挖掘群体内遗传变异。2、项目经验丰富，研究成果发表于Nature Genetics、Nature Communications、Molecular Biology & Evolution等。诺禾致源重测序群体进化发表文章（）参考文献：[1] Hufford M B, Xu X, van Heerwaarden J,et al. Comparative population genomics of maize domestication andimprovement. Nature Genetics, ),44(7): 808-11.[2] Qiu Q, Wang L, Wang K,et al. Yak whole-genome resequencing reveals domestication signatures and prehistoricpopulation expansions. Nature Communications, ), 6:10283.[3] Li M,Tian S,Jin L,et al. Genomic analyses identify distinct patterns of selection in domesticatedpigs and Tibetan wild boars. Nature Genetics, ): 1431-8.[4] Axelsson E, Ratnakumar A, Arendt M L,et al. The genomic signature of dog domestication reveals adaptation to astarch-rich diet. Nature, 2013 Mar 21(3),495(7441): 360-4.（关注诺禾致源公众号 novogene-1，在聊天界面回复日期关键词“”即可下载部分文献原文。注意不是评论区，是聊天界面哦~）动植物重测序事业部 & 徐凤凤 丨文案武苾菲 丨编辑配图来源于网络，侵删长安识别二维码，关注诺禾致源
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(问题由蓝提出)【答题格式为da+答案，例如答案是爱消除，则回复“da爱消除”答题】
答案：da5288
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