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QQ &.&.&〖 _8_〗专业 刷绝版 VIP CF点 各种黄金,茉莉AK等绝版使用百度Hi可以第一时间收到“提问有新回答”========================================================================================================================================《穿越火线》追求的游戏乐趣不仅仅是开枪的爽快感，而且更加核心的乐趣是来自相互合作及默契带来的战略意义。1对1的对决时的实力固然重要，但是没有默契的合作就很难获胜，所以目前大家都积极地寻找合适的路线和战术。《穿越火线》在最近开发的多种在线FPS中，整合了包括《反恐精英》的人气优点并吸取了玩家喜欢的内容，提供了比较丰富的游戏内容。========================================================================================================================================注意：不还价，不赊帐，不外借，不闲聊，不解释，非诚勿扰
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我口袋妖怪黑白2对伍：草主（深绿），路卡里欧（精神力），红霸鳄（自信过胜），风速狗（引火），图腾...
我口袋妖怪黑白2对伍：草主（深绿），路卡里欧（精神力），红霸鳄（自信过胜），风速狗（引火），图腾鸟（魔法守护），帝牙海狮（厚脂肪），求配招，道具！看看特性行吗！还有还用逮大颚蚁（以后进化沙漠蜻蜓）和巨金怪吗！
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通关配招草主：盘绕+报恩+叶刃+种子路卡：阴谋+波导+精干+恶波/龙波
或者剑舞+咬碎+神速+近战鳄：地震+咬碎+逆鳞+石刃狗：焰驱+神速+近战+野电鸟：精转+羽栖+冥想+精干 数不够了
草主大根/剩饭亿万吸收+替身+剧毒+光合作用路卡利欧气息腰带剑舞 咬碎 近身搏击 神速红霸鳄专爱围巾地震 咬碎 瓦割 石刃图腾鸟 火焰珠精神转移鸟栖冥想空气切割
55级左右的沙鳄固执性格攻击速度努力值刷满带上黑眼镜鬼天王和超能天王一路咬碎秒杀 配招的话地震 岩崩 逆鳞 咬碎 练只50多级的达摩性格固执 速度攻击努力值满练出120火招和格斗招 准备几个复活硬拼格斗地面天王
性格？等级？你的草蛇努卡是哪个方向的？等级多少？到现在能学会哪些技能我都不能确定。攻关还是pwt/地铁？不然我怎么告诉你努力分配和配招？难道向楼上一样连那些技能要遗传都不知道就到网上随便复制粘贴？
三头龙一定要
还有灯火幽灵
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出门在外也不愁神奇宝贝超级愿望
《神奇宝贝超级愿望》是系列动画《神奇宝贝》的第四部。本次的故事发生在全新的冒险舞台——“合众地方”。其蓝本是第五代游戏（神奇宝贝黑白），小智与皮卡丘和新伙伴艾莉丝和天桐一起展开为了追寻梦想和冒险以及和各种各样神奇宝贝的邂逅的旅行。这一次画风也有了很大革新，CG技术的使用也让神奇宝贝的绝招更富能量感。2012年剧场版《酋雷姆VS圣剑士凯路迪欧》于日在日本上映，总票房36.1亿日元。2013年剧场版确定为《神速的盖诺赛克特超梦觉醒》，于日上映。在其后，神奇宝贝系列动画的第五部《神奇宝贝XY》于日在日本上映。
ポケットモンスター ベストウイッシュ、Pokémon Best Wishes!
台译：神奇宝贝超级愿望、港译：宠物小精灵 超级愿望、陆译：精灵宝可梦 超级愿望
神奇的口袋中的宝贝简称神奇宝贝（陆：口袋中的精灵简称宝可梦，港：宠物小精灵简称小精灵），是地球上不可思议的动物。影片主要讲述的是少年小智与宠物小精灵的邂逅、冒险和战斗经历的故事。
小智和皮卡丘踏入新的冒险舞台──合众地方(陆：合众地区），这里居住着许多他们所不知道的神奇宝贝（陆：精灵宝可梦，港：宠物小精灵）。当他们初次踏上这片土地时，突如其来的黑云笼罩天空，伴随着神秘的神奇宝贝——捷克罗姆！
随之而来且脱胎换骨的火箭队，以及活动目的不明的神秘团体，在寻找新的神奇宝贝以及新的邂逅的道路上，更多的考验在等着他们。
超级愿望篇和《神奇宝贝超世代》与《神奇宝贝钻石与珍珠》类似，也以小智与皮卡丘前往新地区开始。和过去的情况类似，在新的系列（第一季）开头，上一代的两位主角——小光和小刚，各自怀揣着新的梦想而和小智告别（但在第二季中小光再次登场）。小智在合众地方新的旅行同伴是神秘的少女艾莉丝和三曜道馆的训练家之一的天桐。
同以前一样，在新的系列中，小智也新装登场。此外，合众地方的乔伊和君莎小姐的设计、造型也和前三部中的大不相同。另外值得注意的是本系列中对武藏、小次郎和喵喵这三人的塑造也和之前的非常不同。
其他变更有：在前三部神奇宝贝中心出现的雷打不动的护士神奇宝贝在本部中也不是吉利蛋或幸福蛋，而是合众图鉴中出现的新神奇宝贝差不多娃娃。而君莎小姐所使用的也不是前三部的卡蒂狗或风速狗，而是合众图鉴中出现的新神奇宝贝哈约克。（有的用首席天鹅或双卵细胞球）
另外本系列与前两部的一处大不同是，由于一起旅行的同伴不再是新人协调训练家（小遥和小光都是），因而剧情中基本不会再有前两部中分量颇重的华丽大赛剧情，这点和多年前没有华丽大赛时的神奇宝贝无印极为相似。
本作日在日本首播，至日在日本播出完毕，共142话，也是是神奇宝贝动画的第656话至第797话。新的剧集《神奇宝贝XY》于日展开，其间于10月2日播出特别篇《神奇宝贝THE ORIGIN》、于10月3日播出BW特别篇《天桐与小刚！暴鲤龙的龙鳞之怒!!》。
本作一般认为分为四部分，超级愿望对应黑白版，超级愿望第二季对应黑白2，超级愿望第二季N章则是根据游戏中的剧情，改编了与电浆团相关的内容，超级愿望第二季Da!章为原创内容。详细目录见下文。
原案：田尻智、增田顺一、杉森建
系列构成：冨冈淳广
总监：石原恒和
制作：佐佐木亮（东京电视台）、田中茂裕（MediaNet）、盛武源（ShoPro）
制作担当：加藤浩幸
总导演：汤山邦彦
导演：须藤典彦
制作：东京电视台、MediaNet、ShoPro
角色设定：山田俊也
总作画监督：広冈歳仁
总监督：汤山邦彦
监督：须藤典彦
美术监督：金村胜义
色彩设计：吉野记通
撮影监督：白井久男
编辑：边见俊夫
音乐：宫崎慎二
音响监督：三间雅文
音乐合作：东京电视台音乐
合作：JR东日本企画
动画制作：OLM TEAM IGUCHI
动画制作人：神田修吉
日在中华电信MOD首播，并于日由东森幼幼台播出。以下为东森幼幼播出状况。
无线电视翡翠台播出状况。
此外，由第53集起，无线电视于官方网站中的myTV提供粤语配音版本供香港市民重温，限期为14天。
大陆版权由北京迪美取得，正式名称为《精灵宝可梦 超级愿望》，在爱奇艺上首先更新84集，更新至108集，采用台湾配音。在迅雷，风行等网站更新全部字幕组剧集。
美洛耶塔（声优：中岛爱）
登场于BW82，原形态（声音形态）是一般系与超能力系。它在BW83-84里躲在一旁观看小智对战，对小智的事情比较执着。在BW85时，正式在众人面前出现，而在BW86加入小智一行人。它是十分稀有的旋律神奇宝贝，同时也被水水獭与波加曼所喜欢。BW087变化出兼具一般系与格斗系的舞步形态。在登场之前一直被火箭队追踪，直到BW096与小智和皮卡丘被火箭队抓走，其歌声被用来解开三云神封印。在后面一集被火箭队用来召唤三云神并将三云神转换为灵兽形态以控制合众地方。后来在小智解救美洛耶塔后美洛耶塔让三云神冷静并恢复原形态，之后告别小智一行人并与拉里一起离开。
全图鉴编号：648
黑白编号：145
日文名称：メロエッタ
中文名称：美洛耶塔
英文名称：Meloetta
类 型：旋律神奇宝贝
特 性：天之恩惠（技能追加特效发动率翻倍）
梦境特性：无
身 高：0.6m
体 重：6.5kg
蛋 组：未发现组
经验范围：270~1250000
初始亲密：100
捕捉几率：3（0.39~100%）
携带道具：星之碎片
属性：（歌声形态）一般+超能，（舞步形态）一般+战斗　美洛耶塔有两种形态：
在战斗中使用“古代之歌”可切换歌声形态与舞步形态，同时能力值重新计算。
舞步形态在下场后会复原。【技能“古代之歌”在技能表中没写】
登场人物标注（先以英文名称开头作缩写，次先以日语罗马拼音开头再以中文拼音开头或之后字作缩写，斜体表示回想）
道馆训练家（合众）
T：修帝，J：红豆杉博士或其父亲，R：火箭队（只有两人一猫组除外），D：东·乔治，F：真菰博士，E：大婆婆，B：白露，C：赤霞珠，S：肯尼洋，A：阿戴克，G：蓝葛雷，L：路克，IE：北尚与南厦，Z：竹兰，K：虎彻，V：维吉尔，N：N，P：电浆团，H：帅哥，AC：巴贝娜与荷莲娜
备注一栏有剧透
草炎水系道馆
一般系道馆
地上系道馆
飞行系道馆
N篇章（电浆团）
Da！章（杰可罗拉群岛）
因东日本大地震的海啸和核泄漏事故，部分原定播出内容受影响。原第23、24集的《火箭队VS等离子团团!（前、后篇）》不再播出（在N篇章重新演绎），原26集的《钓鱼酒侍!天桐登场!!》延迟在原BW39（现BW36）之后播出，内容也有少许改动，所以变成BW37。因上述原因，集数编号不能与网上视频对应，所以请自行增加集数2或3集，然后再观看。本排法是根据日本神奇宝贝官网公布的官方排法，请勿自行修改。
本部的播出进程中，也播出过《神奇宝贝钻石&珍珠》的特别篇，但由于并不属于超级愿望篇，因此没有计入本部集数。
第1集 前往合众地方！捷克罗姆的身影！！
　　还没有见过的神奇宝贝…还没有见过的城镇……为了见到未知的事物，小智与皮卡丘到了全新的冒险之地──合众地方！正为了在新天地的冒险雀跃不已时，眼前出现了这地方的神奇宝贝研究权威、红豆杉博士！大家立刻前往研究所，此时，天上突然出现黑云、雷鸣大作！在那中心，有像是黑色巨大神奇宝贝的影子。下一秒，影子放出的雷电直接击中小志的皮卡丘！两颊不断放电让皮卡丘很难过。众人急忙前往博士的研究所详细检查，但是结果却出人意料……皮卡丘竟然不能用电系绝招了！以混乱揭开序幕的旅程，到底会怎麼样呢！？
第2集 艾莉丝与牙牙！
　　虽然皮卡丘身上发生的异变令人困惑，小智他们仍决定要在合众地方旅行。首先是为了收服这个地方的宝贝而进入森林，然後就发现摇摇晃晃的草丛！急忙用图鉴判别，结果显示是「牙神奇宝贝」牙牙！小智马上丢出神奇宝贝球要收服它！但是，神奇宝贝球击中草丛後却传出人的声音！？接著，冲出来的并不是牙牙，是个女孩子！她叫做艾莉丝，而目标牙牙躲在她的头发里！究竟这名神秘少女的真实身分为何…！？
第3集 水水獭！黑眼鳄！危在旦夕！！
　　小智首先以第一间道馆的所在地三曜市为目标。接著，不知为何同行的艾莉丝，在路上遇到叫做阿丹的少年。他家好像在附近开设温泉渡假旅馆，有很自傲的沙浴的样子。正当大家准备做沙浴的时候，周围却不断冒出「沙漠鳄鱼神奇宝贝」黑眼鳄！照阿丹的说法，它们平常非常温顺，会和训练家一起享受沙浴。但是，这些黑眼鳄却突然开始拼命的挖掘地面！ 　　在它们掀起的烟尘中出现的是，带著墨镜的黑眼鳄！无视於一旁惊讶的小智等人，它张开大嘴把皮卡丘与牙牙、以及偷偷跟来的水水獭带走了！这只黑眼鳄的目的到底是什麼！？
第4集 对战俱乐部！神秘的神奇宝贝现身！！
　　朝著三曜市持续旅行的小智一行人，在途中经过的城镇发现有趣的设施。那是被称为「神奇宝贝对战俱乐部」、让训练家可以自由对战的场所。干劲十足的小智猛冲进对战俱乐部！出来迎接的是俱乐部的经理东乔治。一番对谈後，他很快就让带著合众地方很少见的皮卡丘的小智上场。然後，对战开始！但是，正准备一口气发动攻击取得先机的时候，刺耳的警报声大作！似乎是有什麼人侵入仓库的样子。调出摄影机拍到的影像进行确认後，在那里的竟然是……
第5集 三曜道馆VS 爆香猴、冷水猴、花椰猴
　　终於到了三曜市！小智为了在合众地方的第一场道馆赛兴奋不已，这时他面前出现一名叫做天桐的青年。天桐看到艾莉丝与牙牙相处融洽的样子，判断他们的适性很好。原来他具有「神奇宝贝酒侍」的资格，可以看出训练家与神奇宝贝的适合度。因为难得遇到，於是一行人一边聊一边请他带路到三曜道馆。然後，眼前出现了期待已久的三曜道馆！小智进入战斗模式冲了进去！但是，建筑物当中却是一片令人觉得走错地方的景象……
第6集 梦的遗址！食梦梦和梦梦蚀！！
　　结束道馆赛，小智一行人来到神奇宝贝中心让疲累的神奇宝贝复原。这时艾莉丝抱著牙牙急急忙忙冲进来！她怀中的牙牙发出浅浅的粉红色光芒，沉沉昏睡。照她的说法，睡著的牙牙完全叫不起来！就在大家为这件事困惑的时候，一位带著「食梦神奇宝贝」食梦梦的女性出现了！她叫做真菰博士，而且好像知道这种昏睡的原因。小智一行人为了解决这件事而冲出中心，却看到惊人的景象！粉红色光点从天而降，君莎小姐也发出紧急警告。城里陷入恐慌……
第7集 藤藤蛇．迷人收服！？
　　小智、艾莉丝、天桐，决定一起旅行的 3 个人在森林里休息时，「草蛇神奇宝贝」藤藤蛇出现，擅自吃起天桐做的蛋糕！皮卡丘急忙要去阻止它，却莫名其妙地眼冒爱心！看来，似乎是重了藤藤蛇的「迷人」。摆出一副轻视模样看皮卡丘的藤藤蛇，以敏捷的动作逃走。但是，因此燃起熊熊斗志的小智，下定决心非收服它不可，於是开始紧追不舍。究竟小智能不能成功的收服藤藤蛇呢！？
第8集 火红不倒翁与达摩狒狒！钟塔的秘密！
　　朝著下一个目的地前进的路途中，小智一行人与神奇宝贝在河边吃午餐。正当大家和乐融融的用餐时，皮卡丘与牙牙的神奇宝贝食物不见了！正要找出是谁搞的鬼时，出现了 2 只「不倒翁神奇宝贝」火红不倒翁！它们使出「喷射火焰」甩开追上去的小智等人，一转眼就逃跑了。虽然想抓它们，不过治疗受伤的神奇宝贝比较重要，所以大家赶往神奇宝贝中心。可是，2 只火红不倒翁居然出现在那里，而且还再度抢走食物！到底火红不倒翁的目的是什麼…！？
第9集 蜈蚣王发飙！救出牙牙！！
　　艾莉丝与牙牙、天桐与花椰猴，相对的两组人马正在练习对战！但是，面对目前还力量不足的牙牙，花椰猴也降低了绝招的威力。艾莉丝告诉牙牙慢慢变强就好了。牙牙最喜欢总是温柔照顾自己的艾莉丝，於是决定去森林里找树果送她。然後，发现某棵高耸的树上有似乎很美味的树果！牙牙不理会急忙跑来阻止的皮卡丘，爬上了尖细的树枝要摘树果。就在只差一点点的时候，树枝折断让它倒头摔了下来！还落在&巨大蜈蚣神奇宝贝&蜈蚣王身上！受惊的蜈蚣王於是拖著牙牙开始横冲乱撞！
第10集 劲敌对战！强敌轻飘飘！！
　　以七宝道馆为目标，继续旅行的小智一行人，在路过的城镇发现神奇宝贝对战俱乐部！小智马上就跑去找对战对手。结果竟然发现修帝的资料！他立刻提出对战要求，请东乔治先生用实况转播器联络修帝。为了意料外的再战热血沸腾的小智，与一如以往冷淡登场的修帝，展开 5 对 5 的对战！小智派的第一只是水水獭、修帝则选择了「野鸽神奇宝贝」波波鸽。小智与水水獭利用扇贝贝进行独创的攻击！可是，修帝的波波鸽也不遑多让的使出绝招！这场比试，谁会胜利！？
第11集 石居蟹！去夺回自己的房子吧！！
　　持续朝著七宝市旅行的小智一行人，在路途中遇见在切割岩石打造住居的「石居神奇宝贝」石居蟹。在他们观察著这珍贵景象时，又新冒出了三只石居蟹！其中一只顶著特别大的石块，就像是当中的老大一样。这个老大看重的，就是石居蟹努力打造出来的家！下一刻，这 3 只竟然一起攻击石居蟹，夺走了它的石头住家！目睹这种卑劣举动的小智一行人，主动表示要帮石居蟹把家抢回来。石居蟹一开始还是很警戒，不过後来渐渐打开了心扉，接著作战行动终於展开！到底会有何结果呢！？
第12集 破破袋战队与秘密基地！？
　　在旅途中经过的某条路上，眼前出现了骑著三轮车的孩子们……接著，孩子们突然往这边投泥丸子！这些孩子兴高采烈地从遭到直击的小智一行人身边通过。而且，在这个军团中的「垃圾袋神奇宝贝」破破袋还把小智的宝贝帽子捡走了！小智等人急忙要追上去时，一位叫做由梨的女性叫住他们。原来，由梨是刚才那些孩子的幼稚园老师，现在遇上了很大的困扰。大家为了弄清楚来龙去脉而前往幼稚园，却被眼前的景象吓了一跳！幼稚园竟然被垃圾山围起来，建了一座秘密基地，而且孩子们还守在里面不肯出来！
第13集 泡沫栗鼠有洁癖！？
　　小智一行人朝著七宝道馆继续旅行。途中突然冒出一名少女撞向他们！原来她叫白露，是红豆杉博士拜托她来转交东西给小智的。而转交的物品则是徽章收集盒！但是，被收在包包底层的盒子沾满灰尘、脏兮兮的。不过，拿到重要收集盒的小智还是很高兴。可是他高高举起的徽章收集盒突然从手中消失了！同时，有一只「栗鼠神奇宝贝」泡沫栗鼠跑走！它口中就咬著重要的徽章收集盒！小智他们立刻慌张地追上去。兵荒马乱的追逐战，到底会怎麼样呢！？
第14集 七宝市！博物馆大冒险！！
　　终於抵达七宝市的小智一行人，目标当然是在七宝道馆获胜、得到第二个徽章！大家与干劲十足的小智一起前往七宝道馆！可是，位於博物馆的七宝道馆门户紧闭，而且看来不太对劲……正当小智准备进行确认、伸手要开门探看的时候，从一名男性发出惨叫、从长廊另一头跑来！这名惊慌失措的男性叫做木立，是博物馆的副馆长，而他似乎被卷入了大麻烦。仔细询问木立之後才知道，这座博物馆似乎有如妖怪作祟，连续发生了奇妙的现象……
第15集 七宝道馆赛！VS 道馆训练家．芦蕙！
　　解决博物馆奇妙谜团的小智一行人，见到了道馆训练家芦蕙，终於要开始期待已久的道馆赛！不过，要前往对战场地，好像得要回答芦蕙出的任务才行。虽然对意外的发展感到困惑，大家还是惊险过关！总算抵达对战场地。使用一般系神奇宝贝的芦蕙，高声宣告要派出步哨鼠与小约克。向对手展现自己的阵容来观察反应，似乎是七宝道馆的风格。小智也紧握自己选好的 2 颗神奇宝贝球，接著，对战赛开始！芦蕙最初派出的「小狗神奇宝贝」小约克！小智则是派出暖暖猪。可是这场对战赛，竟然出现难以置信的发展！
第16集 再次挑战七宝道馆！新绝招爆发！！
　　赌上第 2 个徽章，与芦蕙进行的道馆赛。可是小智却因为「吼叫」与「黑色眼光」这组联合招式而败下阵来。一心雪耻的小智，到对战俱乐部接受东乔治的特训。当然，暖暖猪与水水獭也一起受训！小智首先与暖暖猪一起，为了对付芦蕙的小约克那招强力「影子球」，进行闪躲球的特训，接著是与水水獭一起下泳池，做逆流而上的特训。他与学会新绝招的2只神奇宝贝，再度前往七宝道馆！可是，对手是身经百战的道馆训练家。对战赛出现意外的发展……
第17集 蛋中孵出的小霸王！
　　之前帮助幼稚园老师由梨时得到的神奇宝贝蛋出现变化！大家对它一边不断摇晃又一边发光的样子兴味盎然。尤其是牙牙，大概是很高兴增加新同伴，特别热心地一直观察。就在闪烁速度变快，看来终於要孵化的时候，开心得手舞足蹈的牙牙竟然撞到了蛋！而蛋就以飞快的速度滚下斜坡！小智等人急忙追上去，可是不断加速的蛋被石头弹起，飞向空中了！这样直接砸到地面的话蛋会破掉的！突然发生重大危机！到底会有什麼结果呢！？
第18集 矢车森林！虫宝包与亚堤！！
　　继续踏上旅程，前往下一间道馆所在地飞云市的小智一行人，在矢车森林遇到一只「裁缝神奇宝贝」虫宝包。为了收服好强不认输的虫宝包，小智热血沸腾地直接往森林深处冲！结果，大家在像迷宫一样的森林里迷路了！3人努力想要回到进森林的路，於是爬上高耸大树找路。可是，小智没有找到路，却找到了吊在树枝上的巨大树叶堆！下一个瞬间，树叶散开，飞云道馆的道馆训练家亚堤竟然飒爽现身！大家一边谈话一边走入森林，就看到刚才见过的虫宝包……
第19集 酒侍对决！石居蟹 VS 双刃丸！！
　　在前往飞云道馆的路上，跃入小智一行人眼帘中的，是新开幕的友好商店！兴奋期待的往里面一看，可以看到最里面出现排队人潮。看样子，似乎是公认神奇宝贝酒侍，在那里品评训练家与神奇宝贝的样子！很感兴趣的小智一跑进去，就遇到一个女孩子。她的名字叫赤霞珠，据说确实具有公认的酒侍资格。小智让她看自己最自豪的神奇宝贝。可是下一个瞬间，眯起眼睛、对著神奇宝贝图鉴开口的赤霞珠，说出令人不敢置信的话……
第20集 皮卡丘对黑眼鳄对鸭宝宝！！
　　小智与皮卡丘目前陪著从蛋里孵出来的滑头小子进行特训。就在打算休息一下吃午餐的时候，他们掉进隧道状的洞穴里了！在抵达地点等著他们的，是以前见过的戴墨镜黑眼鳄！它似乎是为了挑战皮卡丘要求对战，才会挖洞找大家来的。面对斗志高昂的黑眼鳄，小智与皮卡丘决定答应对战。可是，这时冒出一只「水鸟神奇宝贝」鸭宝宝，抢走了黑眼鳄的墨镜！其实这只鸭宝宝超爱恶作剧，它接二连三地做出让小智他们感到困扰的恶作剧，但是……
第21集 天之箭桥与哥德小姐！
　　小智一行人抵达通往飞云市的大桥「天之箭桥」，但是桥上却起了雾、让人看不清楚。无论如何都要赶著过桥的小智他们，毫不在意的开始过桥。这时候，「天体神奇宝贝」哥德小姐从雾中现身，出手攻击他们！不得以之下，小智派出藤藤蛇应战，四周却突然被光线包围，回神过来就发现大夥又回到桥下了。可是，周围看起来却不太对劲……在小智等人正感到不安的时候，一个叫莎丽的少女向他们打招呼！而带著笑容跟在她身边的，正是袭击小智他们的哥德小姐！
第22集 飞云市！百足蜈蚣恐慌！！
　　总算抵达飞云市了。当地不愧是被称为合众地方中心的城市，四处都是高耸的建筑大厦。小智的目的当然是与亚堤进行道馆赛……可是，在街上与一行人偶遇的亚堤却说，现在有很挂心的事情，没心思进行道馆赛。问题就在，城里的虫系神奇宝贝们出现奇怪的反应。为了查明原因，小智他们展开共同行动，最後追到了地下水道。就在那里，出现了一只「蜈蚣神奇宝贝」百足蜈蚣。而且，它就像亚堤说的一样，情绪躁动又显出强烈的敌意。而这个变异，隐藏著令人恐惧的事实！！
　　标题：飞云道馆赛！纯情之心的虫系神奇宝贝对战！ 　　小光漂亮的晋级到第二次审查，接下来终於要进行华丽对战赛！小光与神奇宝贝们都气势十足。这次是要以象牙猪、帕奇利兹搭档配合，不断特训的「冰灿水晶灯」一决胜负。阻挡在小光面前的对手，是在第一次审查演出至今无人见过的强烈表演的乌拉拉！在兴奋狂热的会场，对战开始！首先发动攻势的，是顺著高昂气势出手的乌拉拉。尖牙陆鲨与火精灵的组合招式爆发威力！相对於随後一口气趁胜追击的乌拉拉，小光他们一直难以抓到机会扭转情势。要让这种状况逆转，只能以大绝招放手一搏……究竟这场对战，会由谁获胜！？
　　标题：要小心可爱脸蛋！被导电飞鼠电到发麻！ 　　在与白露同行前往雷文市的途中，「飞鼠神奇宝贝」导电飞鼠出现在小智一行人面前！导电飞鼠帮牙牙捡回树果的可爱模样，把神奇宝贝们都迷倒了。那可爱的模样让白露兴奋不已，马上决定要进行对战收服它！可是，导电飞鼠在对战中使用迷人让对手无法战斗，直接逃走了。白露急急忙忙追上去，但是牙牙不知道为什麼也一起追过去了。它似乎是想要向帮了自己的导电飞鼠回礼。可是这只导电飞鼠有著令人意想不到的秘密……
　　标题：导电飞鼠 VS 藤藤蛇！交换伏特大混乱 　　艾莉丝才刚收服导电飞鼠，就马上开始进行对战特训。可是，一开始和白露的泡沫栗鼠对战，导电飞鼠就在没有指示的状况下使出「交换伏特」，和其他神奇宝贝交换！而且，它的交换伏特有点奇特，就连小智和天桐的神奇宝贝都被拉出来交换！躲在树上高高兴兴看大家慌成一团的导电飞鼠，似乎很爱恶作剧的样子。它使用迷人使唤异性神奇宝贝，又装哭让大家向它道歉，为所欲为！但是，有只以锐利眼神观察这一切的神奇宝贝……
第26集 烛光灵大宅的恐～怖故事！
　　以雷文市为目的地，持续旅行的小智一行人，因为突然下起大雨而四处找地方躲雨。接著小智他们总算找到一栋在山丘上的洋房，决定进去休息一下。但是这时候，书架和花瓶自己动了起来，开始攻击小智一行人！大家一边逃命，一边靠皮卡丘的十万伏特勉强甩开攻击。其实这是「蜡烛神奇宝贝」烛光灵搞的鬼！发现这点的小智等人，追问烛光灵这麼做的原因。而透过萤幕监视他们的人影是……这座宅第隐藏的恐怖秘密即将真相大白！
通往龙之大师之道！牙牙对赤面龙！！
　　在牙牙与滑头小子进行对战特训时，森林中传来神奇宝贝的吼叫声。那声音是「洞穴神奇宝贝」赤面龙发出来的！它还突然使出集气弹攻击，让小智一行人急忙闪避。这时候，有位追著赤面龙而来的训练家。名叫艾咪的少女是赤面龙的训练家，她似乎是跟丢了突然开始大闹的赤面龙。对龙系神奇宝贝特别有兴趣的艾莉丝靠近一看，发现赤面龙的脚上缠了粗重的钢索。看来它是因为这样才开始大闹的。看到艾莉丝的应对方式，艾咪拜托她教导自己龙系神奇宝贝的养育方法……
第28集 失的扇贝贝！水水獭最大的危机！！
　　朝雷文市继续旅行的小智一行人，遇上带著「带电神奇宝贝」斑斑马的训练家甘尼洋要求对战！自愿在这场对战中出场的，竟然是水系的水水獭！它干劲十足，打算用自傲的扇贝贝把任何攻击都打回去。水水獭在对战刚开始的时候华丽的闪躲过电系绝招，但是在被斑斑马威力强大的「连环腿」击中时，重要的扇贝贝被打飞到很远的地方去！水水獭与小智急忙跑去寻找，可是到处都找不到扇贝贝。失去最大的武器，让水水獭哑然失色。为了鼓励水水獭，小智等人开始寻找可以代替扇贝贝的东西，可是……
第29集 恋爱中的木棉球乘风飞翔！
　　小智他们像往常一样进行特训，结果有一只「棉球神奇宝贝」木棉球跑了出来。照天桐的说法，这个时期木棉球会集体行动，然後成双成对的踏上旅程。这只木棉球似乎是和团体走散了。可是他这样是有理由的。滑头小子在草丛的对面发现另一只木棉球！看来最初遇到的木棉球，是因为喜欢上这一只才追过来的。要得到芳心就得展现自己的坚强实力，这是木棉球的规矩。可是，最初遇到的那只木棉球在对战中被轻松打败了。看到它後悔不甘的样子，小智一行人决定帮忙进行对战特训……
第30集 小灰怪与不明飞行物体！
　　为了准备应付前往雷文市的漫长旅程，小智一行人沉沉睡去休养生息时，突然有发出惊人光芒的神秘飞行物体飞过，那行动看来就像幽浮一样……天亮之後，小智他们马上四处打听有关神秘飞行物体的情报，得知有位井守博士住在郊外的研究所。为了向他请教，大夥决定前往研究所，可是，到了门口的3人却遇上不可思议的现象！脑中突然浮现从来没有看过的影像！突然发生的事情让大家感到不安，而且，有个在暗处观察这状况的身影。那是手上光点会不规则闪烁的「脑神奇宝贝」小灰怪……
第31集 劲敌对战！迷你冰、搬运小匠参战！
　　小智一行人继续旅行，在准备吃午餐的时候，意外遇到了带著「新雪神奇宝贝」迷你冰，打算进行对战收服蓝蟾蜍的修帝！但是，小智打乱状况，让蓝蟾蜍跑掉了。在修帝打算离开的时候，小智要求进行对战。原本要拒绝的修帝，因为被艾莉丝笑他想逃走，答应进行 3 对 3 对战！小智最先派出的是藤藤蛇！而修帝派出的是藤藤蛇的进化型，青藤蛇！第 3 次的劲敌对战，会由谁获胜！？
第32集 蓝蟾蜍、泥巴鱼！水边的战斗！！
　　在与修帝对战时，小智发现到水水獭的意外弱点，那就是「在水中睁不开眼睛」。为了立刻开始特训，它们来到一个大水池！小智将其他同伴交给艾莉丝照顾，陪著水水獭特训，但是却一直没有成果。同一时间，艾莉丝放任神奇宝贝四处玩耍，可是滑头小子竟然对躲在草丛中的「蘑菇神奇宝贝」宝贝球菇&使出铁头功！结果，生气的宝贝球菇对大家喷出毒粉末，让大家都中毒倒地！附近没有神奇宝贝中心，在这种危急状况下，能依靠的只有水水獭……最後到底会怎麼样呢！？
龙之破坏者登场！艾莉丝与龙头地鼠！！
　　在前往雷文市的旅途中，突然出现一名拦路挑衅的少女蓝葛雷。她的目标是来自龙之乡的艾莉丝！蓝葛雷似乎是被称为「龙之破坏者」的冰系训练家，而且好像是为了与艾莉丝对战而刻意埋伏等待。受到嚣张挑衅让艾莉丝非常愤怒，决定答应进行对战！蓝葛雷派出的是「结冻神奇宝贝」冻原熊。艾莉丝则是理所当然地选了牙牙应战！可是，不只是适性不佳，遇上冻原熊压倒性的力量，牙牙一下子就失去战斗能力。懊悔不已的艾莉丝，对小智他们说出了藏在心里的想法……
第34集 石丸子！发射电炮光泽吧！
　　继续踏上旅程前往雷文市的小智一行人，在某座森林休息。这时候，冒出了一只「地幔神奇宝贝」石丸子，而且大闹一场！它的举动挑起小智的收服意愿，马上派出水水獭、暖暖猪应战，没想到却惨败！最後还不得不到神奇宝贝中心去治疗。石丸子看著一行人离去，而它会大闹似乎是有原因的……结束治疗後，大家与乔伊小姐聊天的时候，有位男性出现了。他好像是来为突然断水的神奇宝贝中心维修管线。但是，建筑物内都没有问题，原因似乎出现洞窟的水源。而且，这个水源地似乎隐藏著不得了的秘密！！
酒侍侦探天桐！差不多娃娃失踪事件！
　　持续旅行的小智一行人，在浓雾弥漫的森林中迷路了。这时眼前出现人影……大夥儿为了问路靠过去，才发现那是「听力神奇宝贝」差不多娃娃！可是，它看起来不太对劲，完全无视小智他们，摇摇晃晃的走掉了。大家正急著要追上去时，君莎小姐却像要拦路一样的出现了。而且，她竟然还说要逮捕小智一行人！大家想尽办法解开君莎小姐的误会，向她打听详细的状况。根据她的说法，城镇里各处的差不多娃娃都突然失踪了！小智等人也决定协助处理这种异常状态！可是，这个事件却有著意想不到的结局！！
第36集 化石复活！古代怪鸟始祖大鸟！
　　小智一行人，在某个城镇与红豆杉博士及真菰博士重逢。2 位博士正打算以「羽之化石」让「最古鸟神奇宝贝」始祖小鸟复活。将化石放入巨大机械中按下开关、靠梦梦蚀的能量将出力提高後，伴随著机械中传来的吵杂叫声，一只始祖小鸟出现了！只是，才刚醒过来、处於兴奋状态的始祖小鸟向各处胡乱使出「龙吸」！成功安抚始祖小鸟的是小智一行人。感情融洽的小智与始祖小鸟展开了飞上天的特训，火箭队却在这时出现……
第37集 钓鱼酒侍天桐登场！
　　继续旅行的小智一行人，又遇到那个很吵闹的人物……被猛力撞上的小智，照例摔进了河中。一直鞠躬道歉的少女，原来是白露！她是为了报名参加附近城镇的钓鱼大赛而急著赶路。天桐一听说这件事就彻底变脸！他似乎是热爱钓鱼到有了钓鱼酒侍的别名。败在干劲十足的天桐的气势下，於是大家和白露一起去登记参赛。在河边特别设置的会场里，有一大群充满活力的水系神奇宝贝！可是，这场钓鱼大会隐藏了某个秘密…
第38集 索罗亚电影！神奇宝贝骑士传说！
　　小智他们在半路经过的电影院，有了惊人的邂逅！竟然有「恶狐神奇宝贝」索罗亚出现！训练家路克总是用这只爱变成电影女主角的索罗亚当主角拍电影，受到他的邀请，小智一行人也一起参加了电影拍摄！小智演出的，是为了解救索罗亚扮演的公主，勇敢对抗海盗天桐的神奇宝贝骑士！一边为不习惯的演戏苦战，一边努力拍到了剧情高潮场景，也就是完成在传说的龙之大师艾莉丝指导下的修行，终於要与天桐决战的时刻！可是这时候，出现意想不到的人来捣乱，让电影陷入作废的危机……
第39集 全体集合！东乔治对战！
　　完成电影拍摄工作的小智一行人，为了参加东乔治主办的「东乔治对战」，与路克一起来到了雷文镇。至今在旅途中遇到的训练家们也都齐聚一堂！名字很容易叫错的甘尼洋、神奇宝贝酒侍赤霞珠、龙之破坏者蓝葛雷、吵吵闹闹的白露，还有劲敌修帝！而且连天桐、艾莉丝与路克都决定参赛，小智的斗志飙到最高点！伴随著东乔治的开赛宣言，对战分组也陆续出炉。终於到了发表小智对战对手的时候，萤幕上应出来的，竟然是……
激战东乔治对战！藤藤蛇 VS 驹刀小兵！！
　　雷文镇的「东乔治对战」终於开始了。在神奇宝贝对战俱乐部的东乔治所主办的这场对战锦标赛中，小智与碧霞珠展开对战！大显身手的蓝蟾蜍让小智漂亮的通过第一轮。但是，从天桐 VS 修帝、白露 VS 甘尼洋开始，第一轮就接连出现火热的对战！继蓝葛雷、安东尼、小智之後，能够晋级第 2 轮的究竟是谁？接著发表的第2轮对战分组，小智的对手出人意料的是！而藤藤蛇也面临危机！？小智能够扳倒强敌、顺利的打入东乔治对战的准决赛吗？而最後获胜的又会是谁……
　　标题：火热的东乔治对战！导电飞鼠 VS 打击鬼！！ 　　雷文镇神奇宝贝对战俱乐部的东乔治举办了对战锦标赛「东乔治对战」。小智在第 2 轮与龙之破坏者蓝葛雷展开激战，被逼入走投无路的绝境。蓝葛雷的驹刀小兵锐利的攻击，让小智的藤藤蛇苦於应对。小智能够突破这个危机，晋级准决赛吗！？ 随後上场的是天桐 VS 路克、艾莉丝 VS 甘尼洋的对战。天桐的泥巴鱼与路克的燃烧虫、艾莉丝的导电飞鼠与甘尼洋的打击鬼火花四射的猛烈冲突！白热化的对战之後，赢得准决赛的人物，究竟是谁！？
第42集 决战 东乔治对战！小智对艾莉丝
　　东乔治举办了对战锦标赛「东乔治对战」。小智一路过关斩将，朝著决赛前进。接下来的准决赛第 2 场比赛是艾莉丝 VS 路克。艾莉丝的牙牙在大赛中初次参加对战赛，路克的泥偶小人发出的连续攻击令它束手无策，陷入只能闪躲逃避的危机。可是，牙牙在紧要关头使出了新绝招，漂亮的逆转击败路克的泥偶小人，让艾莉丝拿下通往决赛的门票。到了决赛，小智与艾莉丝展开了炽烈的对战！小智艾莉丝在决赛中会选择什麼神奇宝贝！？称霸命运之战，成为东乔治对战优胜者的到底是谁！？
交涉喵喵喵！头巾混混说服作战！！
　　小智他们为了达成得到第 4 个徽章的目标，继续旅行前往下一间道馆的所在地雷文市……可是，他们发现火箭队的喵喵遍体鳞伤地倒在路边。在小智等人的治疗下，喵喵恢复了意识。喵喵说，它是因为执行任务失败而被总部宣布开除，与武藏、小次郎分道扬镳，身心俱疲的四处流浪。看到喵喵这个样子，小智、艾莉丝与天桐提议要它跟大家一起旅行。喵喵也决定答应不再做坏事的约定，加入他们旅行。这时候，牙牙被头巾混混绑走了！？
第44集 小心扒手猫！喵喵与水水獭！！
　　因缘际会下开始与喵喵一起旅行的小智他们，遇上了一只扒手猫。一眼就被「刁蛮神奇宝贝」扒手猫的可爱模样迷倒，喵喵与水水獭竟然为了吸引扒手猫的注意，展开了追求大战。扒手猫则对它们表示自己的朋友被困在洞窟，拜托它们前去帮忙。以前曾经在扒手猫手下吃过苦头的天桐，表明了他不信任对方的立场。但是，小智和艾莉丝还有喵喵和水水獭相信扒手猫，决定跟著它到洞窟去！？
第45集 大宇怪与双卵细胞球与梦境小偷！！
　　小智一行人带著喵喵这个新成员，一起前往雷文市。因为天色暗了下来，一行人开始准备露营，喵喵则去寻找适合当柴火的树枝。在喵喵找不太到适当枯枝的时候，「脑神奇宝贝」大宇怪出现，送给它一整捆木柴。大宇怪表示「可以帮大家实现任何愿望」，提供了现在正缺少的食材。看到这情景，天桐说出了希望在度假饭店套房好好睡一觉的愿望。跟著大宇怪走的小智一行人，在应该什麼都没有的森林中找到一家气派的度假饭店。 虽然感到不可思议，他们还是住了下来，可是……
交涉喵喵喵！ 突破冻原熊的森林吧！
　　在前往雷文市的途中，小智一行人来到了某座山上。当他们在因为暴风雨而一片混乱的山路上前进时，发现了倒在路边的「结冰神奇宝贝」喷嚏熊。为了让喷嚏熊回复体力，大家分头去找食物，但是就在终於找到树果时，「结冻神奇宝贝」冻原熊出现了。喵喵以交涉喵的身分介入，想要安抚激动的冻原熊，可是冻原熊却毫不留情地使出「冻风」攻击过来。在山林保安官克力弗的神奇宝贝「武术神奇宝贝」功夫鼬帮忙下，惊险逃过一劫的他们，能够顺利让喷嚏熊回到原本的族群吗！？
第48集 疾奔！对战地下铁！（後篇）
　　抵达雷文市的一行人，搭乘地下铁前往神奇宝贝中心。天桐这个地下铁酒侍兴奋不已地凝视著驾驶座，但是列车却突然紧急停车。往窗外一看，隔壁的轨道上有从未见过的车型驶过。他们在查探时，与管理雷文市地下铁的地下铁总控官北尚、南厦会合。根据两人的说法，最近出现了不在时刻表上的「幽灵列车」。虽然很在意幽灵列车的真面目，一行人还是前往神奇宝贝中心。听说提供了平常的神奇宝贝中心没有的，让神奇宝贝身心都获得疗愈的特别服务，小智一行人决定把所有神奇宝贝都寄放在这，结果却是！？
道馆训练家是超级模特儿！小菊儿登场！
　　小智等人为了得到第 4 个徽章，与白露来到雷文道馆。雷文道馆的道馆训练家，是使用电系神奇宝贝的当红模特儿小菊儿。白露马上就要求进行道馆赛，没想到到了对战场地，却发现白露的父亲已经等在那里要带她回家。白露试著说服父亲让她继续旅行，但是她父亲却完全听不进去。这时候，小菊儿提议进行道馆赛，让白露的父亲看看她有多少成长。接著白露答应了父亲的条件，只要在与小菊儿的道馆赛中输了就会回家。於是，小菊儿的「雷电神奇宝贝」雷电斑马与白露的「蜗牛神奇宝贝」小嘴蜗展开火热的对战。
第50集 雷文道馆！华丽的电击对战！
　　小智在与小菊儿进行道馆赛之前苦思对策。为了对抗小菊儿强大的电系神奇宝贝，他决定跳过难以让小菊儿的神奇宝贝受到损伤的皮卡丘，另外挑选道馆赛成员。这让干劲十足的皮卡丘感到不满。 　　接著，道馆赛开始。面对小菊儿的「雷电神奇宝贝」雷电斑马，小智派出&震动神奇宝贝&蓝蟾蜍对抗。具有地上系属性的蓝蟾蜍让雷电斑马的电系绝招失效。蓝蟾蜍就像小智预料的一样，打赢了雷电斑马。可是，面对下一个对手「飞鼠神奇宝贝」导电飞鼠，在第一场比赛消耗不少体力的蓝蟾蜍似乎开始显露疲态！？
第51集 小智、天桐对地下铁总控官！
　　打完道馆赛的小智一行人，决定靠参观雷文市来打发到吊桥修好为止的一天时间。地下铁酒侍天桐决定去搭地下铁，参加只要集满戳章就可以与地下铁总控官比赛的地下铁印章计画。另一方面，小智与艾莉丝则是选择四处观光，大家各自活动度过这一天。到大竞技场观看比赛，还去欣赏音乐剧等等，小智他们在雷文市到处参观游玩。不过，他们发现了一只走失的「牙神奇宝贝」牙牙，於是决定帮它找到主人。 　　另外，正在参加地下铁印章计画的天桐，遇见了一名据说与重要朋友走散的少女，开始帮她一起找那个朋友。小智与艾莉丝、还有天桐能够找到他们各自要找的人吗！？
第52集 小智对冠军阿戴克！
　　正要离开雷文市，前往帆巴道馆的小智一行人，在表演者街道上遇见了劲敌修帝。据说他是因为小时候见过合众联盟的冠军阿戴克，才决心以阿戴克为目标，成为强大的神奇宝贝训练家。修帝是听到阿戴克最近会出现在这附近的传闻，才到这里来找人的。接著，见到阿戴克的小智与修帝立刻就要求和他进行对战。与冠军阿戴克的对战就此开始，为了对抗阿戴克的「撞头牛神奇宝贝」爆爆头水牛，小智派出最强的搭档皮卡丘挑战，可是……
前往彩虹另一头！街头沙铃的音乐剧！！
　　朝著帆巴市持续旅行的小智一行人，在某著城镇遇到正在练舞的「仙人掌」神奇宝贝街头沙铃「街头沙铃三重奏」以及它们的训练家。托比欧与「街头沙铃三重奏」想要报名神奇宝贝音乐剧的试镜大会，为了测试实力，他们要参加这城镇的神奇宝贝表演大会。为了得到优胜，托比欧他们不断练习舞蹈结束前的大绝招，可是却不顺利，看到这种情况，小智他们决定一起帮忙，结果却是！？
第54集 芽吹鹿！春夏秋冬全部到齐！！
　　要前往帆巴市的小智一行人，在途中经过的神奇宝贝中心，遇到专门拍摄神奇宝贝的「神奇宝贝摄影师」罗伯特。他让小智等人看了一张同为神奇宝贝摄影师的祖父拍的照片，那上面出现了有著四季不同姿态的「季节神奇宝贝」芽吹鹿齐聚的景象。罗伯特决心要找到祖父去过的地方，拍到春夏秋冬四种型态的芽吹鹿聚集在一起的照片。听到他这种决心，小智等人也决定跟罗伯特一起去找不同外貌的芽吹鹿聚集的地方……
第55集 滑头小子与任性的哥德宝宝！
　　在前往帆巴市的途中，小智他们遇到一只哥德宝宝与它的训练家小春，可是小春是个对任性的「凝视神奇宝贝」哥德宝宝言听计从的训练家。因为哥德宝宝很喜欢小智的滑头小子，让小春拼命地要求小智把滑头小子让给她。小春一直要求用自己手边的神奇宝贝和小智交换滑头小子，可是一直遭到拒绝。之後她提出以对战决定的要求，沉不住气的小智被挑衅成功，答应小春进行对战， 展开一场滑头小子争夺战。滑头小子将有什麼样的命运呢！？
第56集 艾莉丝与单首龙！抚养家修行！！
　　继续旅行前往帆巴市的小智一行人，在途中遇到神奇宝贝抚养家波比与 3 只「粗鲁神奇宝贝」单首龙。这 3 只单首龙是第一次被托付给抚养家照顾，所以想逃走去找训练家。为了帮助没有照顾过龙系神奇宝贝的波比，来自龙之乡的艾莉丝主动说要帮忙，小智他们也决定从旁协助。一群人便立刻开始照顾神奇宝贝，可是其中一只特别怕生，自从被托付给抚养家之後就不吃饭、心情低落的单首龙让大家陷入苦战。艾莉丝努力想与它交心，只是最後的结果会如何发展呢！？
第57集 敏捷☆战士对几何雪男！
　　抵达帆巴市的小智一行人，立刻前往帆巴道馆要进行道馆赛。可是，道馆训练家菊老大似乎正忙著处理事情。在等待道馆开门的时间，决定到帆巴市场逛逛的一行人，遇到了机车骑士查尔斯与他的搭档「去壳神奇宝贝」敏捷虫，并且在他们带领下四处参观。在大家逛街的时候遇到了小偷，这时当地的英雄 &敏捷☆战士& 与敏捷虫现身，帮忙逮捕了犯人。小智因此成了 &敏捷☆战士& 迷。听查尔斯说敏捷☆战士晚上可能出现在港口的仓库街，小智决定去仓库街找他，可是！？
天桐与伯特,兄弟对决! 爆香猴 VS 花椰猴
　　为了准备与帆巴道馆的菊老大进行道馆赛，小智正勤於特训。可是，天桐的兄弟，也是三曜道馆道馆训练家之一的伯特出现了。伯特说想看看天桐修行的成果，突然要求进行神奇宝贝对战。兄弟对战就此开始。伯特派出搭档「高温」神奇宝贝爆香猴，天桐则是以「草猴」神奇宝贝花椰猴迎战，并且漂亮地获胜。把败战责任推到爆香猴身上的伯特，却在被众人责备之後负气跑走。原来，伯特是因为遇上身为道馆训练家的对战瓶颈，在与寇恩吵架之後离家出走了！？
龙卷云 VS 雷电云 VS 土地云！（前篇）
　　菊老大说只要有复活之草就考虑进行对战，於是小智一行人立刻出发前往三云岛。抵达岛上後，他们见到了借助搭档「花饰」神奇宝贝裙儿小姐帮忙，专门采摘复活之草的青年尤特。根据尤特的说法，最近可能是因为三云岛的土地变得贫瘠，草系神奇宝贝都失去活力，甚至连复活之草都枯萎了。尤特与小智一行人遵照三云岛的传说，为了向丰穰之神土地云祈愿，举行了祈雨仪式，可是这时风之神龙卷云却突然出现！？
龙卷云 VS 雷电云 VS 土地云！（後篇）
　　为了得到复活之草，小智一行人开始进行向丰穰之神土地云祈愿的祈雨仪式。可是，出现的却不是土地云，而是让整座岛陷入严重混乱的风之神龙卷云与雷之神雷电云！具有避邪作用的石碑楔石，遭到了不名人士破坏！为了平息两只神奇宝贝的战斗，小智等人努力召唤出了土地云，可是在战斗当中，牙牙与哥德小童都受了重伤。而且火箭队竟然还想捕捉因为战斗而耗尽体力的雷电云、龙卷云和土地云这 3 只传说的神奇宝贝！？
第61集 地底的道馆赛！VS 菊老大！
　　在三云岛顺利取得复活之草的小智一 行人，终於可以和帆巴道馆的道馆训练家菊老大进行道馆赛了。从小就与神奇宝贝一同挖掘矿山的菊老大，对於以「地上」系神奇宝贝为主的力量行对战充满自信。接著道馆赛开始。菊老大的第一只是「沙漠鳄鱼」神奇宝贝混混鳄。小智则是派出「海獭」神奇宝贝水水獭进行挑战。虽然水水獭勇敢的施展喷射水柱进攻，却因为混混鳄的沙雹，眼睛进了沙子。之後，混混鳄对无法准确使出绝招的水水獭发动猛攻。正当大家以为毫无胜算的时候，小智想到的作战方式是什麼呢？
第62集 电电虫，电蜘蛛！电石洞穴！
　　小智一行人继续旅行前往吹寄市，可是皮卡丘却在半路上，被「黏住」神奇宝贝电电虫吸走电力。想要帮助皮卡丘的泥巴鱼与导电飞鼠也同样被吸走电力，造成体力严重耗损。为了救助 3 只神奇宝贝，立刻赶往神奇宝贝中心的众人，从乔伊小姐口中得知那一带本来是没有电电虫的。正当大家感到不可思议时，白露急急忙忙冲进来撞到小智。原来她正赶著要与红豆杉博士联络。白露总算连络上人在电石洞穴的博士，可是实况转播器的通讯却突然中断了。看来是博士所在的洞穴里停电了……
通讯交换进化！骑士蜗牛和敏捷虫！！
　　小智他们见证了白露的「蜗牛」神奇宝贝小嘴蜗，与红豆杉博士的「啃咬」神奇宝贝盖盖虫进行通讯交换的时刻。可是白露的小嘴蜗性格胆怯，就算在交换前进行对战也是被个性积极的盖盖虫压著打，感觉并不顺利。之後，终於开始进行通讯交换！小嘴蜗进化成「去壳」神奇宝贝敏捷虫，盖盖重则是进化成「骑兵」神奇宝贝骑士蜗牛！！可是，来到白露身边的骑士蜗牛与小嘴蜗的时候完全不同，变得很有攻击性，更加难以控制。这时候，红豆杉博士提议要与小智、天桐进行双打对战……
黑英雄的遗迹！象徵鸟与死神棺！！
　　继续旅行前往吹寄市的小智一行人，遇上了传说中的神奇宝贝研究者红豆杉博士的父亲。小智他们听说博士说在附近找到了过去英雄与被称为传说的神奇宝贝捷克罗姆交流的遗迹，现在正要去探查，也拜托他带大家一起去。不过，遗迹似乎是个被古人设置了无数陷阱的危险场所。接下来，才正开始四处探索，就突然遭到遗迹的守护神「化兽鸟」神奇宝贝象徵鸟攻击！小智他们惊险地逃进放在大房间里的棺材，可是那里竟然冒出了「棺木」神奇宝贝死神棺…而且艾莉丝变成木乃伊了！？究竟小智他们能不能平安逃离遗迹呢！？
　　标题：双人对战！皮卡丘，混混鳄对蜈蚣王，蟾蜍王！！ 　　带著墨镜的混混鳄突然出现在小智等人面前。原来，竟然是把皮卡丘当成对手的混混鳄一路追著小智他们来了！这时候，在镇上遇见的少年尼克，拜托小智把皮卡丘借他。问了之後才知道，因为朋友格兰要求进行神奇宝贝对战，可是还不是训练家的他没有神奇宝贝。另一方面，格兰则是要求另一个朋友赛恩去借他父亲的神奇宝贝蜈蚣王与蟾蜍王。小智答应借出皮卡丘，可是…还需要一只神奇宝贝。这时，混混鳄主动说要参战。皮卡丘与混混鳄的组合，到底会有什麼结果？
第66集 爆炸头 GO！爆爆头水牛 NO！！
　　旅途中在森林里迷路时，暖暖猪与水水獭吵了起来。这时候，小智一行人突然遭到「撞头牛」神奇宝贝爆爆头水牛攻击。虽然勉强逃过一劫，可是艾莉丝、暖暖猪、水水獭、藤藤蛇与牙牙他们，和小智等人走散了。艾莉丝他们遇到来巡逻的乔伊小姐与差不多娃娃，得知自己闯进了爆爆头水牛的栖息地。而且爆爆头水牛具有将侵入者视为敌人攻击的习性。为了避免遭到攻击，乔伊小姐提供了爆炸头假发让大家戴上……大家看到彼此戴上假发的样子後开始互相取笑，结果暖暖猪与水水獭又吵了起来。被卷入争吵的牙牙被打飞弄丢了假发，却也弹到了爆爆头水牛的头上！牙牙会怎麼样呢！？
吹寄道馆的空想对战！挑战者天桐！？
　　小智一行人终於抵达吹寄市了。他们前往吹寄道馆找到馆训练家风露，可是道馆却是采取预约制。听说这里的对战是采用空想对战的方式，小智马上就预约了下午的名额。接著就先观察早上的道馆赛状况。没想到，空想对战是展示出彼此要派出的神奇宝贝，在风露的脑袋中进行模拟对战，不实际对战就由她判定结果！看到风露一口气处理完 15 位挑战者的对战要求，深感愤怒的天桐认为「同样身为道馆训练家的我绝对不认同！」於是要求和风露进行道馆赛。风露回应天桐「道馆赛不比不知道结果」的说法，开始进行实际对战，然而！？
第68集 吹寄道馆 VS 风露！空中决战
　　天桐努力说服却毫无成效，风露还是对空想对战充满自信。同样对空想对战怀有疑问的小智要求挑战道馆赛。面对小智的波波鸽，风露派出了波波鸽的进化型轰隆雉鸡迎击！这场比速度的空中战，双方展开一进一退的攻防拉锯。虽然唤回显露疲态的波波鸽，换上皮卡丘应战，可是电系绝招却悉数遭到封锁！面对风露的王牌神奇宝贝「首席天鹅」，波波鸽已经喘不过气…此时，波波鸽出现异状！飞行系神奇宝贝之间的对战将有何结果！？究竟最後，小智能得到第六个徽章吗！？
第69集 突破难关！登上天空之塔！
　　要前往雪花市的小智一行人，偶然地与肯尼洋重逢，并且知道了「许愿钟祭典」的事情，决定全体一起参加。这个祭典是要与一只神奇宝贝组队，通过各种竞技考验。优胜者可以得到权利，敲响据说能「实现任何愿望」的「许愿钟」。小智与皮卡丘也斗志满满的要得到优胜。他们立刻开始寻找借物竞赛需要的「雷之石」，可是皮卡丘碰到的话就会进化！？在模仿大会上，艾莉丝变成红豆杉博士！？天桐虽然完美的变身为小菊儿却被倒喝采！？突破无数难关、怪问题的小智等人背後，突然冒出带著 &脑& 神奇宝贝小灰怪的超能力者礼二……
东乔治格斗大会开幕！滑头小子对花椰猿
　　小智一行人参加了在某格镇举行的对战大会「东乔治格斗大会。肯尼洋、白露、修帝及蓝葛雷这些熟悉的劲敌接连表明参战，开始迸出激烈的火花。「东乔治格斗大会」的主办者是神奇宝贝对战俱乐部的主人东乔治。因为是以肉搏战出名的格斗大会，小智决定选择格斗系的滑头小子当搭档。第一轮当中，小智他们与亚奇的花椰猿展开激战！但是滑头小子因为飞膝撞失败而动弹不得，陷入危机！花椰猿不断使出低空踢，滑头小子接连遭受痛击，倒在对战场地上了。恐怕就到此为止了……当每个人都这麼想的时候，滑头小子受到小智鼓励，靠毅力站起来了！接著，这时候竟然发生异变！？
　　标题：不断继续吧，东乔治格斗大会！赤面龙 vs 劈斩司令！！ 　　神奇宝贝对战俱乐部的东乔治，举办了对战锦标赛「东乔治格斗大会」。火热的第一轮比赛，艾莉丝选择了龙头地鼠当搭档，迎战神奇宝贝女酒侍赤霞珠的双刃丸。面对水系的双刃丸，具有地上系属性的龙头地鼠显得不利…而且，赤霞珠与双刃丸的组合搭档，成长幅度高出神奇宝贝酒侍天桐的预想！艾莉丝该怎麼办！？接著轮到蓝葛雷与葛瑞丝的对战。龙之破坏者蓝葛雷，斗志高昂地要与龙系的赤面龙对战！具有诡异气质的正臣与搭档投射鬼一起出场，与杜蒙的功夫鼬激烈冲突，可是……
激战东乔治格斗大会！劈斩司令对炎武王！！
　　激战不断的肉搏战对战锦标大赛「东乔治格斗大会」，第一轮最後一场对战，是白露的炎武王与修帝的修缮老头激战。这是一场最终进化型神奇宝贝的对决！面对进化後威力提升的修缮老头，炎武王陷入苦战遭遇危机！！就在这时候，白露做出了惊人的指示！？而且，肯尼洋与天桐展开了充满魄力的对战！肯尼洋的打击鬼接连躲过天桐的花椰猴攻击，以浑身之力使出手刀！但是，花椰猴也不甘示弱地使出咬咬攻击企图扭转情势！东乔治认为最有冠军相的正臣与投射鬼，则是游刃有馀的一路过关斩将顺利晋级！？
决战东乔治格斗大会！投射鬼对打击鬼
　　肉搏对战锦标赛「东乔治格斗大会」的战况越来越热烈。准决赛的对战组合是白露的炎武王 VS 肯尼洋的打击鬼。面对以力量见长的炎武王，打击鬼展现速度！利用健美增加攻击力的打击鬼，使出得意的手刀袭向炎武王…接下来，小智与正臣之战揭开序幕。小智的滑头小子在气势上，完全被正臣的投射鬼压制住了。滑头小子使出还无法完美控制的「集气弹」来一决胜负，更展开最擅长的接近战，使出飞膝撞挑战投射鬼，结果却是！？小智的比赛将有何结果！？最後打进决赛，得到优胜了又会是谁！？
第74集 拯救牙牙！铁蚁的巢穴
　　在前往雪花市的途中，小智的宝包茧在和艾莉丝的导电飞鼠进行对战练习时，竟然进化成为「育儿神奇宝贝」保母虫了！保母虫具有用叶子制作衣服代替打招呼的习性。它马上就先为皮卡丘他们制作叶子衣服，还帮高兴得不得了的牙牙做了叶子面具。之後，在小智一行人午睡的时候，牙牙居然被铁蚁给扛走了。它们似乎是把穿著叶子服的牙牙误认为食粮了！为了找寻牙牙，小智他们仰赖保母虫的丝走进迷宫般的铁蚁巢穴。可是，里头有无数的铁蚁……牙牙会怎麼样呢！？
罗斯山的激战！肋骨海龟的奇迹！（前篇）
　　为了前往雪花市，小智一行人决定穿越罗斯山的洞窟，但是却在途中迷路了。循著远方敲打声前进的他们，遇见正捧著大块岩石，非常兴奋的藤夫。原来身为业馀考古学者的藤夫，长年累月不断研究，终於挖到「古代龟神奇宝贝」原盖海龟的化石。据说原盖海龟在很久以前就已经灭绝，可是藤夫却说他在孩提时代曾与活生生的原盖海龟玩耍…当大家在罗斯山探险时，突然穿越时空到了原盖海龟的世界，让他有了不可思议的体验。小智等人对这番故事充满兴趣。就在这时候，化石被火箭队给夺走了！？
罗斯山的激战！肋骨海龟的奇迹！（後篇）
　　罗斯山当中有被称为「时间之门」的时空扭曲存在。火箭队正计画藉由「时间之门」穿越道过去的世界。他们打算大量捕捉过去已灭绝的神奇宝贝，藉此增强战力征服合众地方！！为了让「时间之门」安定，需要「古代龟神奇宝贝」原盖海龟的生物能量…原盖海龟终於还是因为火箭队的化石复原装置，在现代世界复活了。困惑不已的原盖海龟，立刻逃走了。小智一行人找到它，带著它逃进森林，却再度遭到火箭队袭击！此时原盖海龟突然开始发光！？到底是怎麼了！？
第77集 炎之回忆！暖暖猪对炎武王！！
　　小智一行人在彩穗蓬花镇的对战俱乐部休息，他们在那里遇到一名叫蘇瓦玛的少年，没想到他就是暖暖猪的前任训练家！而且，暖暖猪被舍弃的理由竟然是「没有对战的才能」。面对谴责这种做法的小智，蘇瓦玛宣称会用对战证明暖暖猪有多没用。另一方面，暖暖猪忘不掉过去的回忆，看来很没有对战的意愿。知道暖暖猪精彩表现与勤奋努力的藤藤蛇，主动要求参与对战。对手是炎系的「食蚁兽神奇宝贝」食蚁炉，以及暖暖猪的最终进化型态「大火猪神奇宝贝」炎武王。藤藤蛇即使处於不利状态仍然毫不畏惧、气势十足地展开对战！此时的暖暖猪却是…
第78集 哈奇库登场！火神虫的圣山！！
　　小智一行人来到雪花市附近的山上，当大家差点被落石砸中的时候，被正在山麓修行的哈奇库与「结冻神奇宝贝」冻原熊救了一命。原来他们是演出知名电影「冰之三部曲」的电影明星。而且有机会见识哈奇库的修行，让电影酒侍天桐极度兴奋！可是，山区突然乌云密布…感到担心的哈奇库与小智等人前往山里查探，就看到神奇宝贝猎人林藏带著 2 只&漂浮神奇宝贝&胖嘟嘟，打算捕捉「太阳神奇宝贝」火神虫！小智派出混混鳄对战，结果连混混鳄都被捉住了！事情到底会怎麼发展！？
第79集 雪花道馆赛！冰之对战场地！
　　为了赢得第七个徽章，敲开雪花道馆大门的小智，眼前是一片广大的冰之对战场地！道馆训练家哈奇库最擅长运用冰系的神奇宝贝。对上&冰雪神奇宝贝&多多冰，小智派出不擅对付冰系的混混鳄！结果，多多冰发动不留反击馀地的连续攻击……小智只好让受到相当损伤的混混鳄回到神奇宝贝球。倒是对冰系占有优势，属於格斗系的滑头小子，第一次参加道馆赛就表现出色！最後赢战的敌人是雪白冰王冻原熊！小智相信混混鳄「绝对不会输」的意志放手一搏！对冻原熊抱有竞争心的混混鳄，究竟能不能打赢…！？ .
第80集 神奇宝贝酒侍对决! 品评对战!!
　　小智一行人正准备要出发前往双龙道馆，取得最後一个徽章。这时候，突然出现一个宣称正在找天桐的男人，把3个人都强押上车带走。小智他们随後被带到邻近镇的富豪，服部的宅第。原来是服部先生希望请优秀的A级神奇宝贝酒侍帮忙，替他的宝贝女儿小桃选出第一只搭档的神奇宝贝。他请来的另一位酒侍黑皮诺断言，&根神奇宝贝&百合根娃娃是最适合的神奇宝贝，但是小桃却一脸失望…。正当天桐将小桃身上的香味当作提示思考时，号称是S级酒侍的醋霞珠冒了出来！可是总觉得好像在哪里看过他…！？ .
第81集种子铁球研究所！艾莉丝与双倍多多冰
　　打算去搭船的小智一行人，偶然遇见了龙之破坏者蓝葛雷与&暴风雪神奇宝贝&双倍多多冰。蓝葛雷为了得到「提高神奇宝贝能力的苔癣」，正要去种子铁球研究所。被勾起好奇心的小智等人也决定跟她一起去。苔癣是&刺果神奇宝贝&种子铁球将岩石程分吸入体内後生成的。可是在以电石进行测试的房间，突然生出了大样的苔癣，甚至覆盖了研究所！小智等人仓皇避难，但是艾莉丝带著牙牙、水水獭，和她最怕的冰系神奇宝贝双倍多多冰一起被关在研究所屋顶上！双倍多多冰和慢慢接近的苔癣都令艾莉丝感到害怕…！结果到底会怎麼样呢！？ .
第82集 电影对决!合众防卫队,出击!!
　　小智他们终於抵达设有道馆的海港城镇。根据天桐的说法，这里从以前就是电影的摄影场地，最近还有电影主题乐园落成。他们在那里碰巧与路克及&恶狐神奇宝贝&索罗亚重逢。想当电影导演的路克，受邀参加开幕前举办的活动，来到这里要参加电影大赛。参加者要在影城中使用同样的设备、同样的设定拍摄电影，比赛谁的作品优秀。在路克提议下，小智一行人也决定协助他拍电影。主角适合众防卫队的小智、皮卡丘及炒炒猪！艾莉丝饰演女主角，还因为落泪镜头陷入苦战…！？ .
第83集 激战立涌道馆!VS霍米加(前篇)
　　为了得到攸关合众联盟出场权的第8个徽章，小智终於踏进立涌道馆的大门。那里的道馆训练家是超级庞克乐团「瓦斯弹乐团」的霍米加！这间道馆，既是现场演唱会场也是对战场地！在热爱对战&演唱会的观众们包围下，感觉就像球队到客场比赛，不过小智还是靠皮卡丘的十万伏特炒热现场气氛。接著，自信满满的霍米加，竟然提议要采取小智派6只神奇宝贝、自己则派3只来对战的比赛方式…！霍米加派出她在关都收服的&毒气神奇宝贝&瓦斯弹！小智派出轰隆雉鸡对抗瓦斯弹的速度，可是却被「泥巴爆弹」打中，陷入剧毒状态！接下来又是毫不留情地攻击…！究竟最後是谁会获胜呢！？ .
第84集 激战立涌道馆!VS霍米加(後篇)
　　为了得到攸关合众联盟出场权的第8个徽章，小智终於踏进立涌道馆的大门。那里的道馆训练家是超级庞克乐团「瓦斯弹乐团」的霍米加！这间道馆，既是现场演唱会场也是对战场地！在热爱对战&演唱会的观众们包围下，感觉就像球队到客场比赛，不过小智还是靠皮卡丘的十万伏特炒热现场气氛。接著，自信满满的霍米加，竟然提议要采取小智派6只神奇宝贝、自己则派3只来对战的比赛方式…！霍米加派出她在关都收服的&毒气神奇宝贝&瓦斯弹！小智派出轰隆雉鸡对抗瓦斯弹的速度，可是却被「泥巴爆弹」打中，陷入剧毒状态！接下来又是毫不留情地攻击…！究竟最後是谁会获胜呢！？ .
第85集 歌唱吧，美洛耶塔！爱的旋律！！
　　知道合众联盟要在3个月後才举行比赛的小智一行人，在天桐的提议下，决定去吃立涌市的名产冻原熊冰淇淋。没想到，竟然在摊位前遇见神奥地方的冠军竹兰！原来她预定要在笼目镇举行的「神奇宝贝世界锦标赛青少年杯」进行示范表演赛。除了可以亲眼见识竹兰的对战，只要在大会赢得优胜，还能和合众地方的冠军阿戴克对战，这让小智等人都决定参赛。一行人就这样随著竹兰前往小波镇。途中，非常罕见的&旋律神奇宝贝&美洛耶塔出现在大家面前。但是，浑身是伤的它突然倒下…！？ .
第86集 波加曼VS花椰猴！华丽的对战！！
　　小智一行人抵达了东合众的小波镇。在搭车前往竹兰说有人等待的别墅时，&旋律神奇宝贝&美洛耶塔突然出现在车里！看来它很喜欢小智，所以跟了过来。接著，在别墅等待大家的，原来是小光与&企鹅神奇宝贝&波加曼！其实小光是为了磨练神奇宝贝协调训练家的实力，特地来到合众地方的。小智等人就此开始为了准备青少年杯进行集训！这时天桐表示「想要品评神奇宝贝协调训练家的神奇宝贝」，向小光提出对战要求！而火箭队正监视著他们的一举一动…！？ .
第87集 大岩蛇岛野外求生！
　　小智等人在竹兰位於小波镇的别墅，为了准备参加青少年杯而不断特训。想要休息一下的小光提议，到传说有奇特的&岩蛇神奇宝贝&大岩蛇存在的无人岛去玩。在大家沿著海岸边的洞窟探险时，突然遭到大岩蛇攻击。虽然勉强逃过一劫，小智他们却与艾莉丝还有小光走散了。在返回海岸的路上，巨大的大岩蛇再度来袭！！面对兼具地上、岩石属性的大岩蛇，水系的水水獭与波加曼合力击退敌人！但是，又有更多大岩蛇冒了出来！！此时，美洛耶塔开始唱歌，它的模样却…… .
第88集 酒侍侦探天桐！消失的喷嚏熊之谜！
　　正在小波镇进行集训的小智一行人，认识了在寻找&结冰神奇宝贝&喷嚏熊的少年克里斯。原来是他的喷嚏熊从应该是密室的神奇宝贝之家不见了。觉得担心的小智等人也一起帮他寻找。天桐发挥酒侍侦探的力量，在森林中发现可疑足迹，并且推断应该是这些足迹的主人把喷嚏熊带走。因为牙牙发现食物残渣，让天桐更确定犯人身分，继续深入森林。结果，眼前出现了边流鼻水边吃水果的&结冻神奇宝贝&冻原熊！不会吧！？这只冻原熊是克里斯的…！？事件的真相究竟如何！？ .
第89集 艾莉丝与小霸王快龙!!
　　在竹兰的别墅，小智一行人才刚起床整理仪容。这时候，小波镇突然全镇都停电了。不久之後，君莎来别墅拜访竹兰。根据君莎的说法，是这个镇上有名的小霸王&龙神奇宝贝&快龙造成停电的。但是，听到这件事的艾莉丝坚称「龙神奇宝贝绝对没有坏孩子！」直接跑去变电所。追著艾莉丝，小智等人也跟著进入变电所，结果他们发现翅膀受伤的快龙躲在最里面的房间。可是，对人类怀有戒心的快龙开始大闹！天花板就在这时垮下来了！艾莉丝、水水獭、波加曼都被关在那个房间里…！？ .
第90集 青少年杯开幕!快龙对冻原熊!!
　　「神奇宝贝世界锦标赛青少年杯」终於开幕。优胜者可以和合众地方的冠军阿戴克进行对战。大会重头戏之一的公开示范赛，是由神奥地方的冠军竹兰派出的&超音速神奇宝贝&烈咬陆鲨，与合众地方四天王嘉德丽雅的&天体神奇宝贝&哥德小姐进行对战。气氛热烈的会场，到了第一轮比赛更是全场沸腾。艾莉丝的&龙神奇宝贝&快龙vs龙之破坏者蓝葛雷的&结冻神奇宝贝&冻原熊，体型庞大的两者展开魄力满点的对战！快龙面对适性很差、冰系冻原熊的攻击，不知为何都正面迎击接下来！大感头痛的艾莉丝发出的指示，它也完全无视，到底会怎麼样…！？ .
第91集 力量对战！艾莉丝对小光！
　　「神奇宝贝世界锦标赛青少年杯」不断演出热烈战斗！艾莉丝的快龙将在第二轮，与神奇宝贝协调训练家小光的&双牙神奇宝贝&象牙猪对战！艾莉丝在第一轮比赛，因为与快龙的默契问题陷入苦战。虽然快龙这次在开场的时候听从指示，但是这回的对战也没办法照艾莉丝的意思进行…！？另一方面，小光与象牙猪展现了超群的默契配合，接连使出绝招击中对手！这场对战，究竟会如何演变！？此外，天桐与修帝，将要进行在东格斗大会之後的第二次对战！&皇家神奇宝贝&君主蛇VS石居蟹！赌上道馆训练家威严的品评会有何结果…！？ .
第92集 小智、艾莉丝、修帝！最後的对战！
　　终於到了「神奇宝贝世界锦标赛青少年杯」的准决赛！小智派出混混鳄与艾莉丝的快龙进行对战。到了这时候，终於与快龙培养出默契的艾莉丝，开始能抓到对战节奏并且产生自信，很顺利地发动攻势。另一方面，与龙神奇宝贝的适性处於不利地位的混混鳄，遭到快龙的大量绝招攻击，面临重大危机！！可是，这时混混鳄的样子却…！？接著，就在小智与艾莉丝的对战越加白热化时，修帝却显露出游刃有馀的表情，断定不管由谁胜出都只是比赛的过客。将胜过合众地方的冠军阿戴克视为唯一目标的修帝…。到底最後，优胜会落在谁手中！？！？ .
第93集 道别与相遇的青少年杯!
　　在「神奇宝贝世界锦标赛青少年杯」获得的修帝，将派君主蛇与阿戴克的爆爆头水牛对战！为了向阿戴克证明自己有多强，修帝彻底研究了爆爆头水牛的特性与弱点，以准备万全的状态进行挑战。相对於此，阿戴克以冠军身分堂堂接受了这项挑战。但是等在最後的却是意外的结果…！？接著在大会结束後，小光与波加曼告诉大家，他们要到城都地方去参加米可利杯。小智对还没有比试过的小光提出对战的要求！皮卡丘VS&火山神奇宝贝&火岩鼠。彼此了解透彻的对手，展开一场堪称表现旅行成果的对战…！？ .
第94集 青海波道馆赛!巨翅飞鱼VS大剑鬼
　　在青少年杯会场遇见的少年虎彻，要去赢得第8个道馆徽章，小智一行人也决定陪他一起去。一行人决定前往青海波道馆，可是小智与虎彻却在半路上跟天桐、爱丽丝走散了！脱线冒失的训练家，让&波纹神奇宝贝&利欧路与皮卡丘只能苦笑。而且还有更多试炼等著他们…！？之後，大家在虎彻的特技帮忙下，总算抵达了道馆！那里好像是水系的道馆，对战场地被设置在海湾当中。道馆训练家西子伊派出&漂浮神奇宝贝&胖嘟嘟，而虎彻则派出&刺球神奇宝贝&坚果哑铃进行对战！虽然以十万伏特给予胖嘟嘟严重打击，但是在那之後，出现预料之外的状况…！？ .
第95集 幼儿园大骚动！毛头小鹰与秃鹰小子
　　小智一行人为了准备参加合众联盟，正在竹兰的别墅中进行训练。就在让滑头小子练习集气弹的时候，森林的另一头传来的惨叫！大家在那里看到正在吵架的「雏鹰神奇宝贝」毛头小鹰以及「尿布神奇宝贝」秃鹰小子…！原来是练习集气弹打碎的石头弹到毛头小鹰头上，让它误以为是秃鹰小子拿石头丢它！接著神奇宝贝幼儿园的新手保母蕾拉老师出现，叹息的说这两只总是这样吵架。它们就算回到幼儿园也还是一样吵个不停…。於是天桐决定，身为神奇宝贝酒侍的他要找出原因。就在这时候，被蕾拉老师告诫行事过当的秃鹰小子跑出了幼儿园…！？ .
第96集 美洛耶塔与海底的神殿！
　　小智一行人在竹兰的别墅进行特训。以态度表示「我也想要对战」的美洛耶塔，像水水獭下了挑战书！这时候，单方面认定小智他们是坏蛋的青年拉里与「泥偶神奇宝贝」泥偶巨人突然发动攻击！美洛耶塔立刻挺身保护小智，让大家能够解开误会。原来拉里与泥偶巨人是为了保护美洛耶塔，所以走遍各地寻找它。原本住在森林深处某个秘密地点的美洛耶塔，是因为躲避不明人士攻击，才会偶然遇见小智他们的。可是这时候，小智等人发现了可疑的监视机器！发现这个地方也有危险，众人为了保护美洛耶塔而急忙离开别墅，可是眼前竟然出现火箭队的老大坂木…！ .
第97集 灵兽型态合力进击!合众最大的危机!!
　　合众地方压制计画「暴风雨计画」。在火箭队设计下，美洛耶塔与小智及皮卡丘被捉到海底的神殿。原来，坂木企图要利用龙卷云、雷电云与土地云等传说中的3只神奇宝贝来称霸合众地方…。由「写形镜」之力召唤而来的3只神奇宝贝，改变型态为灵兽型态，并在坂木的指示下开始暴走！总算成功逃脱的小智与皮卡丘，立刻前去救援发出悲鸣、痛苦不已的美洛耶塔！！为了解救同伴，皮卡丘发出的电球出现惊人的效果…！？坂木以及在他手下集结的火箭队，与小智等人在合众最大的战斗开始了！！ .
第98集 世界第一华丽的神奇宝贝!?
　　合众联盟的举办地确定为桧垣市，小智一行人於是离开竹兰的别墅准备前去参赛。在森林当中，他们和花园歌剧团的麻雅与&丝巾神奇宝贝&奇诺栗鼠，水树与&花饰神奇宝贝&裙儿小姐以及紫音与&捧花神奇宝贝&罗丝雷朵有了最糟的相遇。被卷入炒炒猪与水水獭争执的导电飞鼠撞上麻雅，结果麻雅竟说导电飞鼠和藤藤蛇都是「丑八怪」，让艾莉丝勃然大怒！！为了要让高傲离去的3人得到教训，小智与天桐也都盛装打扮，前往歌剧团员禁止男宾进入的宿舍。「绽艳方成华，败者凋零化尘泥」！不得了的对战即将开幕…！？ .
第99集 天空与大地的双打对战！
　　小智一行人继续踏上旅途前往要举办合众联盟的桧垣市。突然间，&勇猛神奇宝贝&勇士鹰、&鼹鼠神奇宝贝&螺钉地鼠以及它们的训练家空朗&陆克兄弟出现，向小智与天桐挑战要求进行双打对战！！对手的两只接连使出没有任何人见过的「飞钻翼」、「神鹰遁地」、「廻转钢爪」，以及其他默契配合极佳的合体绝招！相对的轰隆雉鸡与花椰猴也不惶多让的驶出合体绝招应战！究竟最後结果如何…？接著，希望变得更强的二人，接受了天桐这个神奇宝贝酒侍的品评！称霸天空与大地的他们，如果可以在收服水系神奇宝贝，就是海陆空齐备的世界最强组合，到底会怎麼样？ .
第100集 艾莉丝、回到龙之乡！
　　小智一行人前往即将举办合众联盟的桧垣市，途中，他们顺便前往了艾莉丝的故乡──龙之乡。除了向大婆婆报告旅行的状况，艾莉丝也与儿时玩伴菖蒲重逢。这时菖蒲所培育的两只&乱暴神奇宝贝&双头龙出现了。同一天从蛋里孵化，情同兄弟的它们，哥哥今天不知道为什麼无精打采的，当小智等人在菖蒲家用餐的时候，弟弟双头龙突然慌慌张张地跑来。大家跟过去一看，发现哥哥双头龙进化成&凶暴神奇宝贝&三头龙！但是，三头龙对自己的进化大吃一惊，突然开始大闹！艾莉丝说她会设法处理，但是…… .
第101集 双龙道馆！艾莉丝VS夏卡！！
　　小智一行人抵达双龙市。双龙道馆道馆训练家夏卡对战的艾莉丝充满斗志。可是，一想到让她难以招架的夏卡就觉得坐立难安…。艾莉丝为了让自己冷静下来而爬上双龙市的铁塔，引起骚动。不过，与在双龙学园生活时的舍监玛莎女士及学园的神奇宝贝&颚斧神奇宝贝&斧牙龙重逢，让她又重新振作起来。第一次与夏卡对战的後，艾莉丝的独断独行让龙头地鼠封闭了心灵…。这次一定要以两人的搭档合作获胜！艾莉丝使出全力对抗夏卡！&地底神奇宝贝&龙头地鼠将与&颚斧神奇宝贝&双斧战龙进行复仇对战…！！到底会有何结果！？ .
第102集 伊布队出动！神奇宝贝救援队！！
　　来到桧垣市附近山顶的小智一行人，打算强行穿越被岩石阻碍的道路，结果差点从山崖上掉下去。这时候，带著&进化神奇宝贝&伊布的青年巴吉尔与&太阳神奇宝贝&太阳精灵救了大家。巴吉尔与他的父亲和哥哥一起组成神奇宝贝救援队，守护城市。他带领的队伍名叫「伊布队」，是由伊布与伊布的七种进化型态共同进行活动。同一时间，水坝发生事件。水坝管理室的大门被&结霜神奇宝贝&几何雪花栋住，使得戴比困在里面！面对越发紧急的事态，巴吉尔与小智等人前去支援。伊布队能发挥实力吗…！？ .
第103集开幕合众联盟·桧垣大会！小智VS修帝
　　小智一行人终於抵达举办合众联盟的桧垣市，并且和白露、肯尼洋、修帝及巴吉尔等人重逢。大家顺利完成参赛登记後，正准备走回各自的宿舍时，在树林里看见了眼熟的帐棚，原来这次为了绝对不要迟到，虎彻与利欧路从三天前就在这里扎营了，可是一详谈才发现，虎彻竟然还没有登记参加大会。大吃一惊的小智，在通知结束参赛登记的广播声中，急忙拉著虎彻赶往登记柜台！他们到底赶不赶上？接著，预赛终於要开幕了！宿命的对决再次登场，小智的对手是修帝与君主蛇！而小智选的神奇宝贝是…… .
第104集 激战！在劲敌对战中取胜！！
　　接连出现强烈激战的合众联盟预赛中，轮到小智智的皮卡丘VS修帝的君主蛇这场对战！君主蛇以最擅长的必杀技龙尾与困绑连续攻击，让皮卡丘陷入重大危机。即使拼命以十万伏特应战，君主蛇也有秘策应对，这次一定要赢过修帝！小智与皮卡丘可以抢下胜利吗？接下来，劲敌们也在预赛中纷纷演出白热化的对战！复赛第一轮确定有虎彻与白露的对战！大剑鬼VS骑士蜗牛的对战，骑士蜗牛以铁壁提升防御力，使得大剑鬼的攻击一直受阻。困惑不已的虎彻拉弹头带思索对策，究竟结果会怎样…… .
第105集 牙牙！迷路走失了！
　　合众联盟桧垣大会很快地进入赛事中盤，小智等人都先回到宿舍。这时候，皮卡丘发现到…牙牙不见了！！一查才发现，牙牙是去追空中的气球，不小心与小智他们走散了！艾莉丝开始拚命的搜寻牙牙。另一方面，皮卡丘它们以小巷为中心四处寻找牙牙。在过程中，水水獭在巷子里发现满满一箱水果，还把它们全都吃光了。可是那是住在巷子里的&垃圾场神奇宝贝&灰尘山，从附近的住户那里得到的食物。水果就这样没了，让&垃圾袋神奇宝贝&破破袋很难过。於是，愤怒的灰尘山找上因为发现牙牙而松了一口气的皮卡丘它们…！到底会怎麼样呢！？ .
第106集 打击鬼登场！小智对肯尼洋！
　　白热对战不断的合众联盟桧垣大会！顺利晋级第二轮的小智，终於打进第三轮。对手竟然是肯尼洋！东．乔治对战、许愿钟对战、东乔治格斗大会，在各大会中一起战斗的肯尼洋与小智，因为熟知彼此的本领，都是预想了对方选择的神奇宝贝及绝招来准备对战！虽然因为肯尼洋的雷电斑马学会新绝招，出现意外的发展，不过小智的蓝蟾蜍也不服输的应战！然後，面对肯尼洋最强的搭档「空手道神奇宝贝」打击鬼，上场的是一度进行对战，体力大幅消耗的流氓鳄！恶系对上格斗系很不利。小智要怎麼推翻这种状况呢？ .
第107集 小智对虎彻！秘密武器三头龙！
　　晋级第4轮的小智，将要与虎彻进行对战！第4轮的6对6的全面对战！虎彻预告的秘密武器竟然是「凶暴神奇宝贝」三头龙！相对於此，小智派出「矿石神奇宝贝」地幔岩一决胜负！地幔岩以绝招准确的命中威力十足的三头龙！究竟结果会如何？接著，轮到虎彻最後的堡垒兼好搭档「波纹神奇宝贝」利欧路上场，面对它的轰隆雉鸡打算以速度决胜负，可是利欧路竟然跳到轰隆雉鸡身上使出绝招！无法闪避的轰隆雉鸡遭受严重伤害，陷入大危机！虎彻的指示乍看之下是一团乱，可是他与利欧路的默契配合却高人一等！这时，利欧路出现异状…… .
第108集 决战合众联盟！皮卡丘对路卡利欧！
　　激战不断的合众联盟进入第四轮！小智与虎彻的对战成为空前混战！更意外的是虎彻的搭档利欧路进化成为「波导神奇宝贝」路卡利欧了！路卡利欧的绝招威力大幅提升！甚至还学会新绝招，逼得小智与藤藤蛇节节败退，而且已经连战两场的皮卡丘还要与路卡利欧对战！体力严重消耗的皮卡丘，为了避免长期战，决定以速度和路卡利欧拼胜负！虽然路卡利欧在对战中占了上风，但小智企图靠著妙计一击逆转！彼此的一击都确实生效，双方都倒下了。要在合众联盟获胜的意志相互冲突！究竟胜利女神会对谁微笑呢？ .
第109集 红豆杉研究所！展开新旅行！
　　结束合众联盟挑战的小智一行人，前往鹿子镇拜访红豆杉博士。他们在路途中遇见了新人训练家诺诺美，她因为个性慎重小心，所以很犹豫要不要过石桥，慌乱地僵在路中央。小智他们鼓励诺诺美前进後，直接前往研究所。像红豆杉博士报告完合众联盟的成果後，小智一行人决定回到关都地方。这时候诺诺美来到了研究所！左思右想之後，诺诺美决定第一只神奇宝贝要选「火猪神奇宝贝」暖暖猪，并且要与小智合作进行对战天桐 & 艾莉丝的双打对战！就在诺诺美开始享受对战乐趣的时候，突然有机械在他们面前冒出来！感觉似曾相识的三人组，到底是谁…！？
片头曲（OP）
片尾曲（ED）
ポケットモンスター　ベストウイッシュ （发售日）
2011剧场版的区别
1：传说中的神奇宝贝不同
2：传说中的神奇宝贝给小智的能力不同
3：与皮卡丘战斗的神奇宝贝不同（黑：投射鬼；白：打击鬼）
4：走的路径不同（黑：转左；白：转右）
5：德雷多的造型不同
6：德雷多的神奇宝贝不同（黑：人造细胞卵；白：歌德小姐）
7：姜塔的泥偶巨人颜色不同（黑：正常；白：闪光）
8：卡莉塔的三头龙颜色不同（黑：闪光；白：正常）
9：出现的小朋友不同（黑：瑟朵；白：奥德）
10：天桐的篮子颜色不同（黑：蓝色；白：白色）
11：出现的野生神奇宝贝不同（黑：爆爆头水牛，斑斑马，雷电斑马，芽吹鹿（夏）；白：冻原熊，长毛狗，芽吹鹿（秋））
12：主题曲不同（黑：宙 -そら（The Sky）；白：响 -こえ-（The Voice））
酋雷姆的2种新形态：火龙，雷龙形态将会出现在新剧场版，已在海报上亮相。
皮卡丘短篇【「美洛耶塔的闪亮独奏会」（メロエッタのキラキラリサイタル】的主角为旋律神奇宝贝美洛耶塔。
神奇宝贝2013剧场版完整标题为《神速的盖诺赛克特超梦觉醒》，于日上映。
1、以下均为已被台湾、香港和美国确认的名字，请不要乱作修改。
各世代神奇宝贝
2、台湾与香港译名大部分相同，部分不同的以“台湾译名/香港译名”形式说明
全国图鉴：
说的太好了，我顶！
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